E-RNAi: a web application to design optimized RNAi constructs.
E-RNAi: a web application to design optimized RNAi constructs.
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DOI：
10.1093/nar/gki468
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发表时间：
2005-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Boutros M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Arziman Z;Horn T;Boutros M
RNA干扰（RNAi）已成为在全基因组范围内系统地剖析基因功能的强有力的遗传学方法。由于RNAi在无脊椎动物中的快速性和有效性，模式生物如黑腹果蝇和秀丽隐杆线虫对鉴定从早期发育到脂肪储存和衰老的各种生物途径的新组分做出了重大贡献。为了正确评估表型，关键问题仍然是对长双链RNA（dsRNA）进行严格的质量控制，以计算可能掩盖表型数据的潜在脱靶效应。我们在这里描述了一种基于网络的工具来评估和设计优化的双链RNA构建体。此外，该申请还提供了对已发表的预先设计的dsRNA的访问。E-RNAi Web应用程序可在。
RNA interference (RNAi) has become a powerful genetic approach to systematically dissect gene function on a genome-wide scale. Owing to the penetrance and efficiency of RNAi in invertebrates, model organisms such as Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans have contributed significantly to the identification of novel components of diverse biological pathways, ranging from early development to fat storage and aging. For the correct assessment of phenotypes, a key issue remains the stringent quality control of long double-stranded RNAs (dsRNA) to calculate potential off-target effects that may obscure the phenotypic data. We here describe a web-based tool to evaluate and design optimized dsRNA constructs. Moreover, the application also gives access to published predesigned dsRNAs. The E-RNAi web application is available at .
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影响因子：
12.3
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
6.1
作者：
Cui, WW;Ning, JC;Duncan, MK
通讯作者：
Duncan, MK
DOI：
10.1073/pnas.110149597
发表时间：
2000-06-06
影响因子：
11.1
作者：
Clemens, JC;Worby, CA;Dixon, JE
通讯作者：
Dixon, JE
影响因子：
14.9
作者：
Naito, Y;Yamada, T;Saigo, K
通讯作者：
Saigo, K
影响因子：
64.5
作者：
Schwarz, DS;Hutvágner, G;Zamore, PD
通讯作者：
Zamore, PD