Understanding Protein Mobility in Bacteria by Tracking Single Molecules.
Understanding Protein Mobility in Bacteria by Tracking Single Molecules.
复制标题
DOI：
10.1016/j.jmb.2018.05.002
复制
发表时间：
2018-10-26
影响因子：
5.6
通讯作者：
Stracy M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kapanidis AN;Uphoff S;Stracy M
蛋白质扩散对于理解体内蛋白质复合物的形成至关重要，并且一直是细胞中许多荧光显微镜研究的主题;然而，这种显微镜的努力往往受到低灵敏度和分辨率的限制。在过去的十年中，这些限制已经通过新的超分辨率成像方法得到解决，其中大部分依赖于单粒子跟踪和单分子检测;这些方法通过直接可视化蛋白质的运动以及局部和全球环境对扩散的影响，彻底改变了我们对细菌细胞内分子扩散的理解。在这里，我们回顾了使这种实验成为可能的关键方法，特别强调基于光活化荧光蛋白的单分子跟踪版本。我们还讨论了研究，提供估计的时间扩散蛋白需要定位一个目标网站，以及研究扩散物种的化学计量，扩散的稳定和弱相互作用的影响，和大分子结构的蛋白质及其复合物的能力，以访问整个细胞质的限制。
Protein diffusion is crucial for understanding the formation of protein complexes in vivo and has been the subject of many fluorescence microscopy studies in cells; however, such microscopy efforts are often limited by low sensitivity and resolution. During the past decade, these limitations have been addressed by new super-resolution imaging methods, most of which rely on single-particle tracking and single-molecule detection; these methods are revolutionizing our understanding of molecular diffusion inside bacterial cells by directly visualizing the motion of proteins and the effects of the local and global environment on diffusion. Here we review key methods that made such experiments possible, with particular emphasis on versions of single-molecule tracking based on photo-activated fluorescent proteins. We also discuss studies that provide estimates of the time a diffusing protein takes to locate a target site, as well as studies that examined the stoichiometries of diffusing species, the effect of stable and weak interactions on diffusion, and the constraints of large macromolecular structures on the ability of proteins and their complexes to access the entire cytoplasm.
登录
查看更多内容
影响因子：
48
作者：
Abrahamsson, Sara;Chen, Jiji;Hajj, Bassam;Stallinga, Sjoerd;Katsov, Alexander Y.;Wisniewski, Jan;Mizuguchi, Gaku;Soule, Pierre;Mueller, Florian;Darzacq, Claire Dugast;Darzacq, Xavier;Wu, Carl;Bargmann, Cornelia I.;Agard, David A.;Dahan, Maxime;Gustafsson, Mats G. L.
通讯作者：
Gustafsson, Mats G. L.
影响因子：
56.9
作者：
Elf, Johan;Li, Gene-Wei;Xie, X. Sunney
通讯作者：
Xie, X. Sunney
氨基酸饥饿对活大肠杆菌中的Rela扩散行为的影响。
影响因子：
3.6
作者：
Li W;Bouveret E;Zhang Y;Liu K;Wang JD;Weisshaar JC
通讯作者：
Weisshaar JC
DOI：
10.1126/science.aah7084
发表时间：
2017-09-29
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Jones DL;Leroy P;Unoson C;Fange D;Ćurić V;Lawson MJ;Elf J
通讯作者：
Elf J
影响因子：
3.4
作者：
Kumar, Mohit;Mommer, Mario S.;Sourjik, Victor
通讯作者：
Sourjik, Victor