The complete chloroplast genome sequence of the Manglietia longirostrata Sima, a rare and endemic species to china.
The complete chloroplast genome sequence of the Manglietia longirostrata Sima, a rare and endemic species to china.
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中国珍稀特有种长叶木莲叶绿体基因组全序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1791758
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发表时间：
2020-07-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xu T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Luo W;Li Z;Sima Y;Xu T
摘要 长叶木莲(Manglietia longirostrata Sima)是我国特有的珍稀树种。本研究对 M. longirostrata 的完整叶绿体基因组 (cpDNA) 进行了测序和组装。 cpDNA 长度为 160,049 bp，包含一个 88,098bp 的大单拷贝区域 (LSC) 和一个 18,861bp 的小单拷贝区域 (SSC)，每个区域由一对相同的 26,571bp 反向重复 (IR) 区域分隔。基因组包含123个基因，其中73个蛋白质编码基因、8个核糖体RNA基因和37个转移RNA基因。对木兰科植物中长叶木莲的cp基因组和之前报道的11个叶绿体基因组进行系统发育分析表明，长叶木莲与大叶木莲的亲缘关系较近，且Bootstrap值较高。
Abstract Manglietia longirostrata Sima is a rare and endemic species in China. The complete chloroplast genome (cpDNA) of M. longirostrata was sequenced and assembled in this study. The cpDNA is 160,049 bps in length, contains a large single-copy region (LSC) of 88,098 bp and a small single-copy region (SSC) of 18,861 bp, separated by a pair of identical inverted repeat (IR) regions of 26,571 bp, each. The genome contains 123 genes, including 73 protein-coding genes, 8 ribosomal RNA genes, and 37 transfer RNA genes. Phylogenetic analysis of cp genome of M. longirostrata with 11 chloroplast genomes previously reported in the Magnoliaceae shows that M. longirostrata is close to Manglietia megaphylla with high bootstrap value.
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DOI：
10.1080/23802359.2020.1717391
发表时间：
2020-01-27
期刊：
Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子：
--
作者：
Liang A;Luo W;Li Z;Sima Y;Xu T
通讯作者：
Xu T
影响因子：
10.7
作者：
Kumar, Sudhir;Stecher, Glen;Tamura, Koichiro
通讯作者：
Tamura, Koichiro
影响因子：
0.7
作者：
Hu, Xiao-Min;Zeng, Qing-Wen;Fu, Lin
通讯作者：
Fu, Lin
影响因子：
14.9
作者：
Madeira, Fabio;Park, Young Mi;Lopez, Rodrigo
通讯作者：
Lopez, Rodrigo
影响因子：
12.3
作者：
Boetzer M;Pirovano W
通讯作者：
Pirovano W