The complete chloroplast genome sequence of Magnolia delavayi (Magnoliaceae), a rare ornamental and medical tree endemic to China.
The complete chloroplast genome sequence of Magnolia delavayi (Magnoliaceae), a rare ornamental and medical tree endemic to China.
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中国特有珍稀观赏药用树木兰（木兰科）叶绿体基因组全序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1717391
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发表时间：
2020-01-27
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xu T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liang A;Luo W;Li Z;Sima Y;Xu T
白玉兰是中国特有的珍稀名贵观赏树种和重要药用树种。在此，我们组装了M. delavayi的完整叶绿体（cp）基因组序列。其长度为159715 bp，分为4个子区域：大单拷贝区87906 bp，小单拷贝区18761 bp，由两个反向重复区隔开，每个26524 bp。基因组包含77个蛋白质编码基因、6个rnas和29个tRNAs基因。用已有报道的白玉兰叶绿体基因组对其cp基因组进行系统发育分析，结果表明，白玉兰的cp基因组接近于多味白玉兰，具有较高的自举价值。
Abstract Magnolia delavayi is a rare, famous ornamental and important medical tree endemic to China. Here, we assembled the complete chloroplast (cp) genome sequence of M. delavayi. Its length is 159,715 bp with four sub-regions: 87,906 bp of large single-copy region and 18,761 bp of small single-copy region are separated by two inverted repeats regions, each 26,524 bp. The genome contains 77 protein-coding genes, 6 rRNAs, and 29 tRNAs genes. Phylogenetic analysis of cp genome of M. delavayi with previously reported chloroplast genomes in Magnolia shows that M. delavayi is close to M. odoratissima with high bootstrap value.
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