In the fungus where it happens: History and future propelling Aspergillus nidulans as the archetype of natural products research.
In the fungus where it happens: History and future propelling Aspergillus nidulans as the archetype of natural products research.
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DOI：
10.1016/j.fgb.2020.103477
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发表时间：
2020-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Keller NP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Caesar LK;Kelleher NL;Keller NP
1990年，第一个真菌次生代谢产物生物合成基因在构巢曲霉中被克隆。30年后，在这一种真菌中，已有30多个生物合成基因簇（BGCs）与特定的天然产物相关联。虽然这令人印象深刻，但构巢曲霉中超过一半的基因簇仍未被鉴定，其化合物在结构和功能上尚不明确。在此，我们全面回顾了过去使构巢曲霉成为如今天然产物制造大户的进展，重点关注次生代谢产物簇的发现和注释。从基因组测序、异源表达和代谢组学，到CRISPR和表观遗传操作，我们对过去30年中开发和应用的技术演变进行了一次引导性综述。这些见解为未来充分挖掘构巢曲霉以及其他丝状真菌的生物合成潜力的努力提供了视角。
In 1990 the first fungal secondary metabolite biosynthetic gene was cloned in Aspergillus nidulans. Thirty years later, >30 biosynthetic gene clusters (BGCs) have been linked to specific natural products in this one fungal species. While impressive, over half of the BGCs in A. nidulans remain uncharacterized and their compounds structurally and functionally unknown. Here, we provide a comprehensive review of past advances that have enabled A. nidulans to rise to its current status as a natural product powerhouse focusing on the discovery and annotation of secondary metabolite clusters. From genome sequencing, heterologous expression, and metabolomics to CRISPR and epigenetic manipulations, we present a guided tour through the evolution of technologies developed and utilized in the last 30 years. These insights provide perspective to future efforts to fully unlock the biosynthetic potential of A. nidulans and, by extension, the potential of other filamentous fungi.
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影响因子：
3.7
作者：
Bromann K;Toivari M;Viljanen K;Vuoristo A;Ruohonen L;Nakari-Setälä T
通讯作者：
Nakari-Setälä T
DOI：
10.3390/jof4010039
发表时间：
2018-03-20
期刊：
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Basenko EY;Pulman JA;Shanmugasundram A;Harb OS;Crouch K;Starns D;Warrenfeltz S;Aurrecoechea C;Stoeckert CJ Jr;Kissinger JC;Roos DS;Hertz-Fowler C
通讯作者：
Hertz-Fowler C
影响因子：
4.4
作者：
Chiang, Yi-Ming;Szewczyk, Edyta;Oakley, Berl R.
通讯作者：
Oakley, Berl R.
DOI：
10.1073/pnas.1205532110
发表时间：
2013-01-02
影响因子：
11.1
作者：
Andersen, Mikael R.;Nielsen, Jakob B.;Mortensen, Uffe H.
通讯作者：
Mortensen, Uffe H.
影响因子：
5
作者：
Bromann, Kirsi;Toivari, Mervi;Nakari-Setala, Tiina
通讯作者：
Nakari-Setala, Tiina