Massively parallel single-amino-acid mutagenesis.

Massively parallel single-amino-acid mutagenesis.
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DOI:
10.1038/nmeth.3223
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发表时间:
2015-03
期刊:
影响因子:
48
通讯作者:
Shendure, Jay
Shendure, Jay
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:
Kitzman, Jacob O.;Starita, Lea M.;Lo, Russell S.;Fields, Stanley;Shendure, Jay

文献摘要

参考文献

被引文献

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随机诱变方法仅部分覆盖突变空间,并且受到DNA合成长度限制的约束。在这里,我们展示了帕尔斯,一个单一的体积,定点诱变的方法,使用微阵列编程的寡核苷酸。我们创建了包含几乎所有错义突变作为酵母转录因子Gal4(99.9%覆盖率)和人肿瘤抑制因子p53(93.5%)的单例事件的文库。基于PAL的综合错义突变扫描可能有助于结构功能研究,蛋白质工程和临床测序鉴定的变体的解释。
Random mutagenesis methods only partially cover the mutational space, and are constrained by DNA synthesis length limitations. Here, we demonstrate PALS, a single-volume, site-directed mutagenesis approach using microarray-programmed oligonucleotides. We created libraries including nearly every missense mutation as singleton events for the yeast transcription factor Gal4 (99.9% coverage) and human tumor suppressor p53 (93.5%). PALS-based comprehensive missense mutational scans may aid structure-function studies, protein engineering, and the interpretation of variants identified by clinical sequencing.
DOI: 10.1038/nmeth.3027
发表时间: 2014-08
期刊: NATURE METHODS
影响因子: 48
作者:
Fowler, Douglas M.;Fields, Stanley
通讯作者: Fields, Stanley
DOI: 10.1038/nmeth.1416
发表时间: 2010-02
期刊: NATURE METHODS
影响因子: 48
作者:
Hiatt, Joseph B.;Patwardhan, Rupali P.;Turner, Emily H.;Lee, Choli;Shendure, Jay
通讯作者: Shendure, Jay
DOI: 10.1038/nbt.1589
发表时间: 2009-12
影响因子: 46.9
作者:
通讯作者: --
Pfunkel:高效,膨胀,用户定义的诱变。
DOI: 10.1371/journal.pone.0052031
发表时间: 2012
期刊: PloS one
影响因子: 3.7
作者:
Firnberg E;Ostermeier M
通讯作者: Ostermeier M
DOI: 10.1261/rna.040709.113
发表时间: 2013-11
期刊: RNA (New York, N.Y.)
影响因子: --
作者:
Melamed D;Young DL;Gamble CE;Miller CR;Fields S
通讯作者: Fields S