Cost-effective interrogation of single nucleotide polymorphisms using the mismatch amplification mutation assay and capillary electrophoresis.
Cost-effective interrogation of single nucleotide polymorphisms using the mismatch amplification mutation assay and capillary electrophoresis.
复制标题
DOI：
10.1002/elps.201000379
复制
发表时间：
2010-12
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
Keim, Paul
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Price, Erin P.;Matthews, Molly A.;Beaudry, Jodi A.;Allred, Jonathan L.;Schupp, James M.;Birdsell, Dawn N.;Pearson, Talima;Keim, Paul
表征SNP的能力是许多临床诊断、遗传和进化研究的重要方面。在这里，我们设计了一种多重SNP基因分型方法来调查细菌炭疽芽孢杆菌基因组内大量的遗传信息SNP。这种新的方法，毛细管电泳通用尾错配扩增突变检测（CAMIA），允许PCR多重和SNP基因型的自动评分，从而提供了一个快速，经济，更高的通量替代更昂贵的SNP基因分型技术。A组交付了准确的B。与TaqMan实时PCR相比，多重PCR可节省80%以上的试剂成本。当实时PCR技术和仪器不可用时，或者试剂成本过高时，CRYSTIA是SNP基因分型的有力替代品。
The ability to characterize SNPs is an important aspect of many clinical diagnostic, genetic and evolutionary studies. Here, we designed a multiplexed SNP genotyping method to survey a large number of phylogenetically informative SNPs within the genome of the bacterium Bacillus anthracis. This novel method, capillary electrophoresis universal-tail mismatch amplification mutation assay (CUMA), allows for PCR multiplexing and automatic scoring of SNP genotypes, thus providing a rapid, economical, and higher-throughput alternative to more expensive SNP genotyping techniques. CUMA delivered accurate B. anthracis SNP genotyping results and when multiplexed, saved reagent costs by more than 80% compared with TaqMan real-time PCR. When real-time PCR technology and instrumentation is unavailable or the reagents are cost-prohibitive, CUMA is a powerful alternative for SNP genotyping.
登录
查看更多内容
高分辨率熔化用于TP53外显子5-8的突变扫描。
影响因子：
3.8
作者：
Krypuy, Michael;Ahmed, Ahmed Ashour;Etemadmoghadam, Dariush;Hyland, Sarah J.;deFazio, Anna;Fox, Stephen B.;Brenton, James D.;Bowtell, David D.;Dobrovic, Alexander
通讯作者：
Dobrovic, Alexander
影响因子：
9.4
作者：
Leader, Brandon T.;Frye, Jonathan G.;Boyle, David S.
通讯作者：
Boyle, David S.
影响因子：
4.4
作者：
Li, BH;Kadura, I;Watson, DE
通讯作者：
Watson, DE
影响因子：
9.4
作者：
Easterday, WR;Van Ert, MN;Keim, P
通讯作者：
Keim, P
影响因子：
1.8
作者：
Arakawa, H;Watanabe, K;Maeda, M
通讯作者：
Maeda, M