A multi-omic map of the lipid-producing yeast Rhodosporidium toruloides.
A multi-omic map of the lipid-producing yeast Rhodosporidium toruloides.
复制标题
产脂酵母圆红冬孢酵母的多组学图谱
DOI：
10.1038/ncomms2112
复制
发表时间：
2012
影响因子：
16.6
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
三酰甘油是生物燃料开发中最有吸引力的替代原料之一。目前基于油料植物的技术在三酰甘油生产能力和速率方面受到限制。这些限制可以通过将碳水化合物生物转化为脂质来规避;然而，我们对微生物产油性的理解仍然有限。在这里，我们提出了红冬孢酵母，一个强大的三酰甘油生产真菌的多组学分析的结果。基因组和转录组测序数据的组装揭示了20.2 Mb的基因组包含8，171个蛋白质编码基因，其中大多数具有多个内含子。包括一种新的脂肪酸合成酶的基因被预测参与非产油酵母中不存在的代谢途径。转录组学和蛋白质组学数据表明，氮限制条件下的脂质积累与诱导脂肪生成、含氮化合物再循环、大分子代谢和自噬相关。绘制了R.因此，圆酵母为合理设计脂质生产途径的努力提供了宝贵的资源。产油真菌为生物燃料生产脂质的能力尚未开发，部分原因是缺乏工程化工业菌株所需的遗传信息。Zhuet al. toruloides，并确定与脂质生产相关的转录组和蛋白质组的变化。
Triacylglycerols are among the most attractive alternative raw materials for biofuel development. Current oil plant-based technologies are limited in terms of triacylglycerol production capacity and rate. These limitations may be circumvented by biotransformation of carbohydrates into lipids; however, our understanding of microbial oleaginicity remains limited. Here we present the results of a multi-omic analysis of Rhodosporidium toruloides, a robust triacylglycerol-producing fungus. The assembly of genome and transcriptome sequencing data reveals a genome of 20.2 Mb containing 8,171 protein-coding genes, the majority of which have multiple introns. Genes including a novel fatty acid synthase are predicted to participate in metabolic pathways absent in non-oleaginous yeasts. Transcriptomic and proteomic data suggest that lipid accumulation under nitrogen-limited conditions correlates with the induction of lipogenesis, nitrogenous compound recycling, macromolecule metabolism and autophagy. The multi-omic map of R. toruloides therefore provides a valuable resource for efforts to rationally engineer lipid-production pathways. The ability of oleaginous fungi to produce lipids for biofuels remains untapped, in part due to a lack of genetic information required to engineer industrial strains. Zhuet al. present the genome of R. toruloides, and identify transcriptomic and proteomic changes associated with lipid production.
登录
查看更多内容
影响因子：
--
作者：
Hynes, Michael J.;Murray, Sandra L.
通讯作者：
Murray, Sandra L.
影响因子：
2.7
作者：
Botes, AL
通讯作者：
Botes, AL
影响因子：
56.9
作者：
Jenni, Simon;Leibundgut, Marc;Ban, Nenad
通讯作者：
Ban, Nenad
影响因子：
5.3
作者：
Knothe, Gerhard
通讯作者：
Knothe, Gerhard
DOI：
10.1016/j.bbalip.2009.04.002
发表时间：
2009-06
影响因子：
4.8
作者：
Bickel, Perry E.;Tansey, John T.;Welte, Michael A.
通讯作者：
Welte, Michael A.