The quantitative proteome of a human cell line.

The quantitative proteome of a human cell line.
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DOI:
10.1038/msb.2011.82
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发表时间:
2011-11-08
影响因子:
9.9
通讯作者:
--
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:

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生成生物过程的数学模型,在不同条件下模拟这些过程,以及比较和整合多个数据集是系统生物学的明确目标,这些目标需要系统组件的绝对数量的知识。到目前为止,细胞蛋白质浓度的系统估计已经异常稀缺。在这里,我们提供了一个常用的人类细胞系在两个功能状态,间期和有丝分裂的蛋白质组的定量描述。我们表明,这些人类培养的细胞表达至少10000种蛋白质,并且定量的蛋白质跨越7个数量级的浓度范围,每个细胞高达20000000个拷贝。我们讨论了蛋白质丰度如何与功能和进化联系在一起。
The generation of mathematical models of biological processes, the simulation of these processes under different conditions, and the comparison and integration of multiple data sets are explicit goals of systems biology that require the knowledge of the absolute quantity of the system's components. To date, systematic estimates of cellular protein concentrations have been exceptionally scarce. Here, we provide a quantitative description of the proteome of a commonly used human cell line in two functional states, interphase and mitosis. We show that these human cultured cells express at least ∼10 000 proteins and that the quantified proteins span a concentration range of seven orders of magnitude up to 20 000 000 copies per cell. We discuss how protein abundance is linked to function and evolution.
DOI: 10.1038/msb.2011.38
发表时间: 2011-07-19
影响因子: 9.9
作者:
通讯作者: --
DOI: 10.1038/nature08184
发表时间: 2009-08-06
期刊: Nature
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作者:
Malmström J;Beck M;Schmidt A;Lange V;Deutsch EW;Aebersold R
通讯作者: Aebersold R
DOI: 10.1038/nature08869
发表时间: 2010-04-01
期刊: Nature
影响因子: 64.8
作者:
通讯作者: --
DOI: 10.1038/nmeth.1390
发表时间: 2009-11
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作者:
Beck, Martin;Malmstroem, Johan A.;Lange, Vinzenz;Schmidt, Alexander;Deutsch, Eric W.;Aebersold, Ruedi
通讯作者: Aebersold, Ruedi
DOI: 10.1074/mcp.m500061-mcp200
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Ishihama, Y;Oda, Y;Mann, M
通讯作者: Mann, M