In silico analysis of plant and animal transposable elements

In silico analysis of plant and animal transposable elements
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植物和动物转座因子的计算机分析

DOI:
10.1504/ijbra.2014.060763
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发表时间:
2014
影响因子:
--
通讯作者:
Wanwipa Vongsangnak
Wanwipa Vongsangnak
中科院分区:
--
文献类型:
--
作者:
Moli Huang;Songsak Wattanachaisaereekul;Yu;Wanwipa Vongsangnak

文献摘要

参考文献

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转座因子(te)在真核生物的进化中起着重要的作用。te根据其在基因组中的特性广泛分布。本研究利用生物信息学和芯片突变的方法阐明了陆生动植物TEs的分子特征。我们发现富含gc的I类TEs在动物中占主导地位,而富含at的II类TEs在植物中普遍存在。富含gc的I类TEs似乎是在动物体内进化而来的。相反,保存在富含at的II类te中被认为对宿主防御系统有贡献。
Transposable Elements (TEs) play important roles in the evolution of eukaryotic organisms. TEs widely distribute depending on their properties present in the genome. This study elucidated the molecular characteristics of TEs in land plants and animals using bioinformatics and in silico mutational approach. We discovered that the GC-rich class I TEs is the predominant class of TEs in animal, but the AT-rich class II TEs is prevalent in plants. The GC-rich class I TEs appears to be evolved within the animals. On contrary, the preserved in AT-rich in class II TEs is believed to be contributed in host defence systems.
DOI: 10.1073/pnas.94.15.7704
发表时间: 1997-07-22
影响因子: 11.1
作者:
Kidwell, MG;Lisch, D
通讯作者: Lisch, D
DOI: 10.1126/science.1178534
发表时间: 2009-11-20
期刊: SCIENCE
影响因子: 56.9
作者:
Schnable, Patrick S.;Ware, Doreen;Wilson, Richard K.
通讯作者: Wilson, Richard K.
DOI: 10.1105/tpc.6.6.907
发表时间: 1994-06-01
期刊: PLANT CELL
影响因子: 11.6
作者:
BUREAU, TE;WESSLER, SR
通讯作者: WESSLER, SR
DOI: 10.1073/pnas.0308084100
发表时间: 2004-02-03
影响因子: 11.1
作者:
Jurka, J;Kohany, O;Jurka, MV
通讯作者: Jurka, MV