The iPlant Collaborative: Cyberinfrastructure for Plant Biology.
The iPlant Collaborative: Cyberinfrastructure for Plant Biology.
复制标题
DOI：
10.3389/fpls.2011.00034
复制
发表时间：
2011
影响因子：
5.6
通讯作者：
Stanzione D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Goff SA;Vaughn M;McKay S;Lyons E;Stapleton AE;Gessler D;Matasci N;Wang L;Hanlon M;Lenards A;Muir A;Merchant N;Lowry S;Mock S;Helmke M;Kubach A;Narro M;Hopkins N;Micklos D;Hilgert U;Gonzales M;Jordan C;Skidmore E;Dooley R;Cazes J;McLay R;Lu Z;Pasternak S;Koesterke L;Piel WH;Grene R;Noutsos C;Gendler K;Feng X;Tang C;Lent M;Kim SJ;Kvilekval K;Manjunath BS;Tannen V;Stamatakis A;Sanderson M;Welch SM;Cranston KA;Soltis P;Soltis D;O'Meara B;Ane C;Brutnell T;Kleibenstein DJ;White JW;Leebens-Mack J;Donoghue MJ;Spalding EP;Vision TJ;Myers CR;Lowenthal D;Enquist BJ;Boyle B;Akoglu A;Andrews G;Ram S;Ware D;Stein L;Stanzione D
Iplant合作（IPLANT）是美国国家科学基金会（NSF）资助的项目，旨在创建一种创新，全面和基础的网络基础设施，以支持植物生物学研究（PSCIC，PSCIC，）。 IPLART正在开发网络基础设施，使构成植物生物学的各个领域的科学家都可以以新的方式应对巨大的挑战，以刺激和促进跨学科研究，促进生物学和计算机科学研究的互动，并培训下一代科学家关于在研究和教育中使用网络基础设施。满足人类对农业和森林产品的预计需求，并期望对自然生态系统进行可持续管理将需要信息技术的应用协同作用。 Iplant网络基础设施设计基于空前的研究社区输入时期，并利用了物理科学的高性能计算，数据存储和网络基础结构的发展。 Iplant是一个开源项目，具有应用程序编程接口，使社区可以扩展基础架构以满足其需求。 Iplant正在赞助社区驱动的研讨会，通过分析工具集成和假设测试来解决特定的科学问题。这些研讨会教导研究人员如何将生物信息学工具和/或数据集添加到Ipleant网络基础设施中，使植物科学家可以在大型数据集上进行复杂的分析，而无需掌握命令行或高性能计算服务。
The iPlant Collaborative (iPlant) is a United States National Science Foundation (NSF) funded project that aims to create an innovative, comprehensive, and foundational cyberinfrastructure in support of plant biology research (PSCIC,). iPlant is developing cyberinfrastructure that uniquely enables scientists throughout the diverse fields that comprise plant biology to address Grand Challenges in new ways, to stimulate and facilitate cross-disciplinary research, to promote biology and computer science research interactions, and to train the next generation of scientists on the use of cyberinfrastructure in research and education. Meeting humanity's projected demands for agricultural and forest products and the expectation that natural ecosystems be managed sustainably will require synergies from the application of information technologies. The iPlant cyberinfrastructure design is based on an unprecedented period of research community input, and leverages developments in high-performance computing, data storage, and cyberinfrastructure for the physical sciences. iPlant is an open-source project with application programming interfaces that allow the community to extend the infrastructure to meet its needs. iPlant is sponsoring community-driven workshops addressing specific scientific questions via analysis tool integration and hypothesis testing. These workshops teach researchers how to add bioinformatics tools and/or datasets into the iPlant cyberinfrastructure enabling plant scientists to perform complex analyses on large datasets without the need to master the command-line or high-performance computational services.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1098/rsbl.2003.0025
发表时间：
2003-08-07
影响因子：
4.7
作者：
Hebert, PDN;Ratnasingham, S;deWaard, JR
通讯作者：
deWaard, JR
影响因子：
3
作者：
Feng X;Grossman R;Stein L
通讯作者：
Stein L
影响因子：
7.4
作者：
Buell, C. Robin;Last, Robert L.
通讯作者：
Last, Robert L.
影响因子：
14.9
作者：
Hull D;Wolstencroft K;Stevens R;Goble C;Pocock MR;Li P;Oinn T
通讯作者：
Oinn T
DOI：
10.1111/j.1365-313x.2010.04129.x
发表时间：
2010-03
期刊：
The Plant journal : for cell and molecular biology
影响因子：
--
作者：
Benfey PN;Bennett M;Schiefelbein J
通讯作者：
Schiefelbein J