AphidBase: a centralized bioinformatic resource for annotation of the pea aphid genome.
AphidBase: a centralized bioinformatic resource for annotation of the pea aphid genome.
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DOI：
10.1111/j.1365-2583.2009.00930.x
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发表时间：
2010-03
影响因子：
2.6
通讯作者：
Tagu D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Legeai F;Shigenobu S;Gauthier JP;Colbourne J;Rispe C;Collin O;Richards S;Wilson AC;Murphy T;Tagu D
AphidBase是一个集中的生物信息资源，由国际蚜虫基因组学联盟（IAGC）开发，以促进豌豆蚜虫基因组的社区注释。AphidBase信息系统旨在为大型国际社区组织和分发基因组数据和注释，使用通用模式生物数据库（GMOD）的开源软件工具构建。该系统包括Apollo和GBrowse实用程序以及wiki，blast搜索功能和全文搜索引擎。在豌豆蚜虫基因组的社区注释过程中，AphidBase强烈支持社区在基因模型的管理方面的合作和协调。AphidBase可以在http://www.aphidbase.com上访问。
AphidBase is a centralized bioinformatic resource that was developed to facilitate community annotation of the pea aphid genome by the International Aphid Genomics Consortium (IAGC). The AphidBase Information System designed to organize and distribute genomic data and annotations for a large international community was constructed using open source software tools from the Generic Model Organism Database (GMOD). The system includes Apollo and GBrowse utilities as well as a wiki, blast search capabilities and a full text search engine. AphidBase strongly supported community cooperation and coordination in the curation of gene models during community annotation of the pea aphid genome. AphidBase can be accessed at http://www.aphidbase.com.
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