How the pan-genome is changing crop genomics and improvement.
How the pan-genome is changing crop genomics and improvement.
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DOI：
10.1186/s13059-020-02224-8
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发表时间：
2021-01-04
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Hirsch CN
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Della Coletta R;Qiu Y;Ou S;Hufford MB;Hirsch CN
近年来，由于测序技术、组装方法和计算资源的改进，作物基因组学取得了巨大的进步。这些进步导致了新工具的发展，以促进作物改良。对物种内结构变异和泛基因组特征的研究揭示了物种内个体间广泛的基因组含量变异，这是作物基因组学和改良的范式转变。在这里，我们回顾了作物基因组学的进展，以及这些工具的利用如何在许多作物物种可用的泛基因组的基础上发生变化。在线版本包含补充材料，可在10.1186/s13059-020-02224-8获得。
Crop genomics has seen dramatic advances in recent years due to improvements in sequencing technology, assembly methods, and computational resources. These advances have led to the development of new tools to facilitate crop improvement. The study of structural variation within species and the characterization of the pan-genome has revealed extensive genome content variation among individuals within a species that is paradigm shifting to crop genomics and improvement. Here, we review advances in crop genomics and how utilization of these tools is shifting in light of pan-genomes that are becoming available for many crop species. The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13059-020-02224-8.
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DOI：
10.1534/g3.114.011551
发表时间：
2014-05-22
期刊：
G3 (Bethesda, Md.)
影响因子：
--
作者：
Anderson JE;Kantar MB;Kono TY;Fu F;Stec AO;Song Q;Cregan PB;Specht JE;Diers BW;Cannon SB;McHale LK;Stupar RM
通讯作者：
Stupar RM
影响因子：
4.9
作者：
Bao W;Kojima KK;Kohany O
通讯作者：
Kohany O
影响因子：
3.1
作者：
de Oliveira, Amanda Avelar;Pastina, Maria Marta;Alves Margarido, Gabriel Rodrigues
通讯作者：
Alves Margarido, Gabriel Rodrigues
影响因子：
30.8
作者：
Chia, Jer-Ming;Song, Chi;Ware, Doreen
通讯作者：
Ware, Doreen
影响因子：
64.8
作者：
D'Hont, Angelique;Denoeud, France;Wincker, Patrick
通讯作者：
Wincker, Patrick