Polyamines accelerate codon recognition by transfer RNAs on the ribosome.
Polyamines accelerate codon recognition by transfer RNAs on the ribosome.
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DOI：
10.1021/bi1009776
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发表时间：
2010-08-24
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
Joseph, Simpson
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hetrick, Byron;Khade, Prashant K.;Lee, Kristin;Stephen, Jenise;Thomas, Alex;Joseph, Simpson
核糖体对氨酰基-tRNA 的选择是蛋白质合成延伸循环中的一个基本步骤。 tRNA 选择是一个多步骤过程，确保只接受正确的氨酰基-tRNA，而拒绝错误的氨酰基-tRNA。 tRNA 选择的关键步骤是在氨酰基-tRNA 的反密码子和 A 位点的 mRNA 密码子之间形成碱基对，称为“密码子识别”。在这里，我们报告了一种新的基于荧光的动力学测定的开发，用于监测核糖体对密码子的识别。使用该测定，我们表明密码子识别是最佳条件下的二阶结合步骤。此外，我们还发现，在低 Mg2+ 浓度下，多胺精胺和亚精胺会刺激核糖体对密码子的识别，而不会损失保真度。多胺可以通过改变氨酰-tRNA 反密码子臂的结构和动力学来加速密码子识别。
The selection of aminoacyl-tRNAs by the ribosome is a fundamental step in the elongation cycle of protein synthesis. tRNA selection is a multistep process that ensures only correct aminoacyltRNAs are accepted, while incorrect aminoacyl-tRNAs are rejected. A key step in tRNA selection is the formation of base pairs between the anticodon of the aminoacyl-tRNA and the mRNA codon in the A site, called “codon recognition”. Here, we report the development of a new, fluorescence-based, kinetic assay to monitor codon recognition by the ribosome. Using this assay we show that codon recognition is a second-order binding step under optimal conditions. Additionally, we show that at low Mg2+ concentration, the polyamines spermine and spermidine stimulate codon recognition by the ribosome without loss of fidelity. Polyamines may accelerate codon recognition by altering the structure and dynamics of the anticodon arm of the aminoacyl-tRNA.
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影响因子：
14.9
作者：
Amarantos, I;Kalpaxis, DL
通讯作者：
Kalpaxis, DL
影响因子：
16
作者：
Johansson, Magnus;Bouakaz, Elli;Ehrenberg, Mans
通讯作者：
Ehrenberg, Mans
DOI：
10.1073/pnas.0705988104
发表时间：
2007-08-21
影响因子：
11.1
作者：
Lee, Tae-Hee;Blanchard, Scott C.;Chu, Steven
通讯作者：
Chu, Steven
DOI：
10.1006/bbrc.2000.2601
发表时间：
2000-05-19
影响因子：
3.1
作者：
Igarashi, K;Kashiwagi, K
通讯作者：
Kashiwagi, K
影响因子：
2.9
作者：
Hetrick, Byron;Lee, Kristin;Joseph, Simpson
通讯作者：
Joseph, Simpson