Omics meet networks - using systems approaches to infer regulatory networks in plants.
Omics meet networks - using systems approaches to infer regulatory networks in plants.
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DOI：
10.1016/j.pbi.2009.11.005
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发表时间：
2010-04
影响因子：
9.5
通讯作者：
Benfey PN
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Moreno-Risueno MA;Busch W;Benfey PN
在过去的几年里，已经产生了许多植物基因组规模的数据集。这一重大成就带来了令人印象深刻的进展，包括一些任何多细胞生物体中最详细的分子图谱。利用转录组、全基因组转录因子结合、蛋白质组和代谢组数据重建了网络和途径，并随后用于推断基因、蛋白质和代谢物之间的功能相互作用。然而，需要更复杂的系统生物学方法来整合不同的组学数据集。最终，将不同的海量数据集整合到连贯的模型中将提高我们对构成生物过程基础的分子网络的理解。
Many genomic-scale datasets in plants have been generated over the last few years. This substantial achievement has led to impressive progress, including some of the most detailed molecular maps in any multicellular organism. Networks and pathways have been reconstructed using transcriptome, genome-wide transcription factor binding, proteome and metabolome data, and subsequently used to infer functional interactions among genes, proteins and metabolites. However, more sophisticated systems biology approaches are needed to integrate different omics data sets. Ultimately, the integration of diverse and massive datasets into coherent models will improve our understanding of the molecular networks that underlie biological processes.
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DOI：
10.1126/science.1162327
发表时间：
2009-06-26
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Badis G;Berger MF;Philippakis AA;Talukder S;Gehrke AR;Jaeger SA;Chan ET;Metzler G;Vedenko A;Chen X;Kuznetsov H;Wang CF;Coburn D;Newburger DE;Morris Q;Hughes TR;Bulyk ML
通讯作者：
Bulyk ML
影响因子：
4.5
作者：
Morohashi, Kengo;Grotewold, Erich
通讯作者：
Grotewold, Erich
拟南芥根生长和发育的功能基因组学。
影响因子：
9.5
作者：
Iyer-Pascuzzi A;Simpson J;Herrera-Estrella L;Benfey PN
通讯作者：
Benfey PN
影响因子：
7
作者：
Ma, Shisong;Gong, Qingqiu;Bohnert, Hans J.
通讯作者：
Bohnert, Hans J.
影响因子：
7.4
作者：
Dembinsky, Diana;Woll, Katrin;Hochholdinger, Frank
通讯作者：
Hochholdinger, Frank