O-glycoprotein biosynthesis: site localization by Edman degradation and site prediction based on random peptide substrates.
O-glycoprotein biosynthesis: site localization by Edman degradation and site prediction based on random peptide substrates.
复制标题
O-糖蛋白生物合成：通过 Edman 降解进行位点定位和基于随机肽底物的位点预测。
DOI：
10.1007/978-1-61779-513-8_5
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发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Gerken,ThomasA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gerken,ThomasA
粘蛋白型o糖基化的表征在几乎每一个分析水平上都充满了极大的困难：从难以获得适合研究的糖肽，它们的结构异质性，缺乏能够简化聚糖的广谱作用糖苷酶工具，以及对多个糖基化的糖肽进行分析的巨大复杂性。这一点，再加上缺乏启动粘蛋白型o糖基化的转移酶的已知肽序列基序，极大地阻碍了我们对粘蛋白型o糖基化的理解，从它们的生物合成到它们的生物学和生物物理性质。在本章中，使用部分化学去糖基化结合Edman氨基酸测序来定量o -糖基化位点。此外，描述了定向随机肽底物的使用，以提供多肽α- n -乙酰半乳糖氨基转移酶的特异性，可用于估计转移酶的o糖基化特异性位点。
The characterization of mucin-type O-glycosylation is fraught with extreme difficulty at almost every level of analysis: from difficulties in obtaining glycopeptides suitable for study, their structural heterogeneity, lack of broad acting glycosidase tools capable of simplifying the glycans, and finally the vast complexity of performing analysis on multiply glycosylated glycopeptides. This, along with a lack of known peptide sequence motif(s) for the transferases that initiate mucin-type O-glycosylation, significantly hinders our understanding of mucin-type O-glycosylation at almost every level from their biosynthesis to their biological and biophysical properties. In this chapter, the use of partial chemical deglycosylation coupled with Edman amino acid sequencing is described to quantify sites of O-glycosylation. In addition, the use of oriented random peptide substrates is described for providing the specificities of the polypeptide α-N-acetylgalactosaminyltransferases, which can be used to estimate transferase-specific sites of O-glycosylation.
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