DIYA: a bacterial annotation pipeline for any genomics lab.
DIYA: a bacterial annotation pipeline for any genomics lab.
复制标题
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp097
复制
发表时间：
2009-04-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Read TD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Stewart AC;Osborne B;Read TD
摘要：DIYA(DIY-YOY Annotator)是一个模块化的、可配置的开源管道软件，用Perl编写，用于快速注释细菌基因组序列。该软件目前用于以完整基因组或鸟枪测序结果的形式将DNA重叠群作为输入，并以Genbank文件格式产生注释序列作为输出。可用性：分发版本和源代码可在(https://sourceforge.net/projects/diyg/).)上获得补充信息：补充数据可在BioInformation Online上获得。
Summary:DIYA (Do-It-Yourself Annotator) is a modular and configurable open source pipeline software, written in Perl, used for the rapid annotation of bacterial genome sequences. The software is currently used to take DNA contigs as input, either in the form of complete genomes or the result of shotgun sequencing, and produce an annotated sequence in Genbank file format as output. Availability: Distribution and source code are available at (https://sourceforge.net/projects/diyg/). Contact: tread@emory.edu Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.
登录
查看更多内容
影响因子：
3
作者：
Yu C;Zavaljevski N;Desai V;Johnson S;Stevens FJ;Reifman J
通讯作者：
Reifman J
影响因子：
7
作者：
Stein, LD;Mungall, C;Lewis, S
通讯作者：
Lewis, S
影响因子：
5.8
作者：
Almeida, LGP;Paixao, R;Vasconcelos, ATR
通讯作者：
Vasconcelos, ATR
影响因子：
14.9
作者：
Van Domselaar GH;Stothard P;Shrivastava S;Cruz JA;Guo A;Dong X;Lu P;Szafron D;Greiner R;Wishart DS
通讯作者：
Wishart DS
影响因子：
4.4
作者：
Aziz RK;Bartels D;Best AA;DeJongh M;Disz T;Edwards RA;Formsma K;Gerdes S;Glass EM;Kubal M;Meyer F;Olsen GJ;Olson R;Osterman AL;Overbeek RA;McNeil LK;Paarmann D;Paczian T;Parrello B;Pusch GD;Reich C;Stevens R;Vassieva O;Vonstein V;Wilke A;Zagnitko O
通讯作者：
Zagnitko O