BioGRID: a general repository for interaction datasets.
BioGRID: a general repository for interaction datasets.
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Biogrid：交互数据集的一般存储库。
DOI：
10.1093/nar/gkj109
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发表时间：
2006-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Tyers, Mike
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Stark, Chris;Breitkreutz, Bobby-Joe;Reguly, Teresa;Boucher, Lorrie;Breitkreutz, Ashton;Tyers, Mike
获得蛋白质和遗传相互作用的统一数据集对于询问基因/蛋白质功能和分析全球网络特性至关重要。BioGRID是一个免费访问的物理和遗传相互作用数据库，可在。BioGRID发布版本2.0包括来自酿酒酵母、秀丽隐杆线虫、黑腹果蝇和智人的116 000种相互作用。最近，通过对酿酒酵母主要文献的详尽整理，从5778个来源中增加了超过30000个相互作用。内部超链接的Web界面允许快速搜索和检索交互数据。完整的或用户定义的数据集可以作为制表符分隔的文本文件和PSI-MI XML免费下载。交互的预计算图形布局以各种文件格式提供。用户定制的嵌入蛋白质、基因和相互作用属性的图表可以通过一个名为Osprey的可视化系统构建，该系统动态链接到BioGRID。
Access to unified datasets of protein and genetic interactions is critical for interrogation of gene/protein function and analysis of global network properties. BioGRID is a freely accessible database of physical and genetic interactions available at . BioGRID release version 2.0 includes >116 000 interactions from Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster and Homo sapiens. Over 30 000 interactions have recently been added from 5778 sources through exhaustive curation of the Saccharomyces cerevisiae primary literature. An internally hyper-linked web interface allows for rapid search and retrieval of interaction data. Full or user-defined datasets are freely downloadable as tab-delimited text files and PSI-MI XML. Pre-computed graphical layouts of interactions are available in a variety of file formats. User-customized graphs with embedded protein, gene and interaction attributes can be constructed with a visualization system called Osprey that is dynamically linked to the BioGRID.
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影响因子：
12.3
作者：
Breitkreutz BJ;Stark C;Tyers M
通讯作者：
Tyers M
影响因子：
64.8
作者：
Gavin, AC;Bösche, M;Superti-Furga, G
通讯作者：
Superti-Furga, G
影响因子：
14.9
作者：
Harris, MA;Clark, J;White, R
通讯作者：
White, R
影响因子：
14.9
作者：
Christie, KR;Weng, S;Cherry, JM
通讯作者：
Cherry, JM
DOI：
10.1073/pnas.0409522102
发表时间：
2005-02-08
影响因子：
11.1
作者：
Sharan, R;Suthram, S;Ideker, T
通讯作者：
Ideker, T