Reordering contigs of draft genomes using the Mauve aligner.
Reordering contigs of draft genomes using the Mauve aligner.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp356
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发表时间：
2009-08-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Perna NT
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rissman AI;Mau B;Biehl BS;Darling AE;Glasner JD;Perna NT
摘要：Mauve Contig Mover 提供了一种新方法，用于根据与完整或草图参考基因组的比较来提出构成基因组草图的重叠群的相对顺序。紫红色对准器和查看器的新颖应用提供了自动重新排序算法以及强大的向下钻取显示，允许详细探索结果。可用性：该软件可从 http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve 下载。联系方式：rissman@wisc.edu 补充信息：补充数据可在 Bioinformatics online 和 http://gel.ahabs.wisc.edu 获取
Summary: Mauve Contig Mover provides a new method for proposing the relative order of contigs that make up a draft genome based on comparison to a complete or draft reference genome. A novel application of the Mauve aligner and viewer provides an automated reordering algorithm coupled with a powerful drill-down display allowing detailed exploration of results. Availability: The software is available for download at http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve. Contact: rissman@wisc.edu Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online and http://gel.ahabs.wisc.edu
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