Occupancy of chromatin organizers in the Epstein-Barr virus genome.
Occupancy of chromatin organizers in the Epstein-Barr virus genome.
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DOI：
10.1016/j.virol.2011.04.004
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发表时间：
2011-06-20
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Miranda JJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Holdorf MM;Cooper SB;Yamamoto KR;Miranda JJ
人CCCTC结合因子CTCF调节疱疹病毒双链DNA基因组的转录。结构复杂的粘附素和RNA聚合酶II也有助于这种组织。我们在潜伏感染的细胞培养模型中分析了Epstein-Barr病毒附加型基因组上CTCF、粘附素和RNA聚合酶的占有率。CTCF与粘附素而不是RNA聚合酶共定位。CTCF和粘着蛋白结合整个基因组中的特定序列，这些序列不仅靠近潜伏基因的调控元件，而且靠近裂解基因。除了与已知的转录物一起追踪外，RNA聚合酶还出现在两个未注释的位置，其中一个位于潜在的复制起点内。每种蛋白质的广泛占有分布揭示了在无数调节元件附近或处的结合，并表明了上下文依赖性功能。
The human CCCTC-binding factor, CTCF, regulates transcription of the double-stranded DNA genomes of herpesviruses. The architectural complex cohesin and RNA Polymerase II also contribute to this organization. We profiled the occupancy of CTCF, cohesin, and RNA Polymerase on the episomal genome of the Epstein-Barr virus in a cell culture model of latent infection. CTCF colocalizes with cohesin but not RNA Polymerase. CTCF and cohesin bind specific sequences throughout the genome that are found not just proximal to the regulatory elements of latent genes, but also near lytic genes. In addition to tracking with known transcripts, RNA Polymerase appears at two unannotated positions, one of which lies within the latent origin of replication. The widespread occupancy profile of each protein reveals binding near or at a myriad of regulatory elements and suggests context-dependent functions.
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影响因子：
8
作者：
Martinez, Selena R.;Miranda, J. J. L.
通讯作者：
Miranda, J. J. L.
影响因子：
64.5
作者：
Kim, Tae Hoon;Abdullaev, Ziedulla K.;Ren, Bing
通讯作者：
Ren, Bing
DOI：
10.1073/pnas.78.2.805
发表时间：
1981-01-01
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA-BIOLOGICAL SCIENCES
影响因子：
--
作者：
LERNER, MR;ANDREWS, NC;STEITZ, JA
通讯作者：
STEITZ, JA
影响因子：
64.8
作者：
Hadjur, Suzana;Williams, Luke M.;Ryan, Natalie K.;Cobb, Bradley S.;Sexton, Tom;Fraser, Peter;Fisher, Amanda G.;Merkenschlager, Matthias
通讯作者：
Merkenschlager, Matthias
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--