The first complete chloroplast genome of Hylomecon japonica and its phylogenetic position within Papaveraceae.

The first complete chloroplast genome of Hylomecon japonica and its phylogenetic position within Papaveraceae.
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DOI:
10.1080/23802359.2019.1573125
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发表时间:
2019-07-12
期刊:
Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子:
--
通讯作者:
Sun Z
Sun Z
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
Zhang Y;Lee J;Liu X;Sun Z

文献摘要

参考文献

被引文献

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Hylomecon japonica 是东亚广泛分布的物种,是一种有价值的园艺和药用植物。在这里,我们获得了粳稻叶绿体基因组的第一个完整序列。完整的cp基因组长160,011bp,有一个大的单拷贝区域(LSC,88,165bp)和一个小的单拷贝区域(SSC,18,378bp),由一对反向重复序列(IR,26,734bp)分隔开。 cp基因组包含114个独特基因,其中包括80个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。系统发育分析表明H. japonica与Coreanomecon hylomeconoides关系密切。
Hylomecon japonica, a widespread species in East Asia, is a valuable horticultural and medicinal plant. Here, we obtained the first complete sequence of the H. japonica chloroplast genome. The complete cp genome was 160,011 bp long, with a large single-copy region (LSC, 88,165 bp) and a small single copy region (SSC, 18,378 bp) separated by a pair of inverted repeats (IRs, 26,734 bp). The cp genome contained 114 unique genes, including 80 protein-coding genes, 30 tRNA genes, and four rRNA genes. The phylogenetic analysis indicated that H. japonica is close related with Coreanomecon hylomeconoides.
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