Chemical Approaches To Analyzing RNA Structure Transcriptome-Wide.
Chemical Approaches To Analyzing RNA Structure Transcriptome-Wide.
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DOI：
10.1002/cbic.202000340
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发表时间：
2021-04-06
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Spitale RC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
England WE;Garfio CM;Spitale RC
RNA分子可以折叠成复杂的二维和三维形状，这对它们的功能至关重要。化学探针长期以来被用于研究RNA结构，现在被认为是研究结构与功能之间关系的宝贵资源。最近，深度测序和精细化学探针设计的力量已经融合在一起，使研究人员能够全面了解RNA结构如何被利用来控制RNA生物学转录组。在这篇综述中，我们概述了用于询问细胞内RNA结构的化学探针设计的最新进展，并讨论了通过化学探针我们对RNA生物学的理解的最新进展。
RNA molecules can fold into complex two- and three-dimensional shapes that are critical for their function. Chemical probes have long been utilized to interrogate RNA structure and are now considered invaluable resources in the goal of relating structure to function. Recently, the power of deep sequencing and careful chemical probe design have merged, permitting researchers to obtain a holistic understanding of how RNA structure can be utilized to control RNA biology transcriptome-wide. Within this review, we outline the recent advancements in chemical probe design for interrogating RNA structures inside cells and discuss the recent advances in our understanding of RNA biology through the lens of chemical probing.
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DOI：
10.1261/rna.067868.118
发表时间：
2019-01
期刊：
RNA (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Mitchell D 3rd;Renda AJ;Douds CA;Babitzke P;Assmann SM;Bevilacqua PC
通讯作者：
Bevilacqua PC
DOI：
10.1261/rna.058586.116
发表时间：
2017-01
期刊：
RNA (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Krokhotin A;Mustoe AM;Weeks KM;Dokholyan NV
通讯作者：
Dokholyan NV
影响因子：
14.8
作者：
Smola MJ;Weeks KM
通讯作者：
Weeks KM
影响因子：
2.9
作者：
Chan, Dalen;Feng, Chao;Spitale, Robert C.
通讯作者：
Spitale, Robert C.
影响因子：
14.8
作者：
Ding, Yiliang;Kwok, Chun Kit;Assmann, Sarah M.
通讯作者：
Assmann, Sarah M.