The UCSC Genome Browser database: 2019 update.
The UCSC Genome Browser database: 2019 update.
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DOI：
10.1093/nar/gky1095
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发表时间：
2019-01-08
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kent WJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Haeussler M;Zweig AS;Tyner C;Speir ML;Rosenbloom KR;Raney BJ;Lee CM;Lee BT;Hinrichs AS;Gonzalez JN;Gibson D;Diekhans M;Clawson H;Casper J;Barber GP;Haussler D;Kuhn RM;Kent WJ
UCSC基因组浏览器（https://genome.ucsc.edu）是探索基因组注释的图形查看器。近二十年来，浏览器为遗传学和分子生物学提供了可视化工具，并继续添加新的数据和功能。今年，我们添加了一个新工具，该工具使用户可以交互式将现有的图形轨道安排为新组。其他软件添加包括用于染色体相互作用的新格式，用于轨道轮毂的CHIP-SEQ峰显示以及改善对HGV的支持。在注释方面，我们添加了GNOMAD，TCGA表达，RefSeq功能元素，GTEX EQTL，CRISPR指南，Snppedia，并在人类基因组上创建了30 noway的灵长类动物对齐。现在有九个组件具有RefSeq-MAPPAPT的基因模型。
The UCSC Genome Browser (https://genome.ucsc.edu) is a graphical viewer for exploring genome annotations. For almost two decades, the Browser has provided visualization tools for genetics and molecular biology and continues to add new data and features. This year, we added a new tool that lets users interactively arrange existing graphing tracks into new groups. Other software additions include new formats for chromosome interactions, a ChIP-Seq peak display for track hubs and improved support for HGVS. On the annotation side, we have added gnomAD, TCGA expression, RefSeq Functional elements, GTEx eQTLs, CRISPR Guides, SNPpedia and created a 30-way primate alignment on the human genome. Nine assemblies now have RefSeq-mapped gene models.
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影响因子：
14.9
作者：
NCBI Resource Coordinators
通讯作者：
NCBI Resource Coordinators
遗传对人体组织基因表达的影响。
影响因子：
64.8
作者：
GTEx Consortium;Laboratory, Data Analysis &Coordinating Center (LDACC)—Analysis Working Group;Statistical Methods groups—Analysis Working Group;Enhancing GTEx (eGTEx) groups;NIH Common Fund;NIH/NCI;NIH/NHGRI;NIH/NIMH;NIH/NIDA;Biospecimen Collection Source Site—NDRI;Biospecimen Collection Source Site—RPCI;Biospecimen Core Resource—VARI;Brain Bank Repository—University of Miami Brain Endowment Bank;Leidos Biomedical—Project Management;ELSI Study;Genome Browser Data Integration &Visualization—EBI;Genome Browser Data Integration &Visualization—UCSC Genomics Institute, University of California Santa Cruz;Lead analysts:;Laboratory, Data Analysis &Coordinating Center (LDACC):;NIH program management:;Biospecimen collection:;Pathology:;eQTL manuscript working group:;Battle A;Brown CD;Engelhardt BE;Montgomery SB
通讯作者：
Montgomery SB
影响因子：
14.9
作者：
Sloan CA;Chan ET;Davidson JM;Malladi VS;Strattan JS;Hitz BC;Gabdank I;Narayanan AK;Ho M;Lee BT;Rowe LD;Dreszer TR;Roe G;Podduturi NR;Tanaka F;Hong EL;Cherry JM
通讯作者：
Cherry JM
影响因子：
7
作者：
Harrow J;Frankish A;Gonzalez JM;Tapanari E;Diekhans M;Kokocinski F;Aken BL;Barrell D;Zadissa A;Searle S;Barnes I;Bignell A;Boychenko V;Hunt T;Kay M;Mukherjee G;Rajan J;Despacio-Reyes G;Saunders G;Steward C;Harte R;Lin M;Howald C;Tanzer A;Derrien T;Chrast J;Walters N;Balasubramanian S;Pei B;Tress M;Rodriguez JM;Ezkurdia I;van Baren J;Brent M;Haussler D;Kellis M;Valencia A;Reymond A;Gerstein M;Guigó R;Hubbard TJ
通讯作者：
Hubbard TJ
影响因子：
14.9
作者：
Volders PJ;Verheggen K;Menschaert G;Vandepoele K;Martens L;Vandesompele J;Mestdagh P
通讯作者：
Mestdagh P