POPdemog: visualizing population demographic history from simulation scripts.
POPdemog: visualizing population demographic history from simulation scripts.
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POPdemog：通过模拟脚本可视化人口统计历史。
DOI：
10.1093/bioinformatics/bty184
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发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Browning,SharonR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhou,Ying;Tian,Xiaowen;Browning,BrianL;Browning,SharonR
我们提出了POPdemog，这是一个R包，它将合并仿真程序的输入参数转换为人口统计模型的可视化表示。这个包是有用的准备数字，检查人口模拟参数已被正确指定，并了解其他研究人员用来模拟遗传数据的人口模型。POPdemog包支持ms， msa, msHot, MaCS, mprime， scrm和Cosi2程序，并包括自定义输出图形的选项。可用性和实施POPdemog软件包及其教程可从https://github.com/YingZhou001/POPdemog.Supplementary上免费下载information补充数据可在bioinformatics online上获得。
SummaryWe present POPdemog, an R package which converts coalescent simulation program input parameters into a visual representation of the demographic model. This package is useful for preparing figures, for checking that demographic simulation parameters have been correctly specified, and for understanding demographic models that other researchers have used to simulate genetic data. The POPdemog package supports the ms, msa, msHot, MaCS, msprime, scrm and Cosi2 programs, and includes options for customizing the output figures.Availability and implementationThe POPdemog package and its tutorial can be freely downloaded from https://github.com/YingZhou001/POPdemog.Supplementary informationSupplementary data are available atBioinformaticsonline.
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影响因子：
64.8
作者：
Jumper J;Evans R;Pritzel A;Green T;Figurnov M;Ronneberger O;Tunyasuvunakool K;Bates R;Žídek A;Potapenko A;Bridgland A;Meyer C;Kohl SAA;Ballard AJ;Cowie A;Romera-Paredes B;Nikolov S;Jain R;Adler J;Back T;Petersen S;Reiman D;Clancy E;Zielinski M;Steinegger M;Pacholska M;Berghammer T;Bodenstein S;Silver D;Vinyals O;Senior AW;Kavukcuoglu K;Kohli P;Hassabis D
通讯作者：
Hassabis D
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通讯作者：
Kern, Andrew D.
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通讯作者：
K. Simonsen;G. Churchill;C. Aquadro
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通讯作者：
Fumagalli, Matteo
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通讯作者：
R. Hudson;N. Kaplan