Plug-and-play analysis of the human phosphoproteome by targeted high-resolution mass spectrometry.
Plug-and-play analysis of the human phosphoproteome by targeted high-resolution mass spectrometry.
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DOI：
10.1038/nmeth.3811
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发表时间：
2016-05
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Villén J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lawrence RT;Searle BC;Llovet A;Villén J
研究细胞信号传导的系统方法需要新的磷酸蛋白质组学技术，该技术可以在多个重复、条件和时间点上重复测量相同的磷酸肽。在这里，我们提出了一种方法，从大规模的，异构的磷酸蛋白质组学数据集挖掘信息，快速生成强大的靶向测定。我们通过询问IGF-1/AKT信号通路证明了我们方法的性能;并表明即使很少观察到的磷酸化事件也可以被一致地检测和精确定量。
Systematic approaches to study cellular signaling require new phosphoproteomic techniques that reproducibly measure the same phosphopeptides across multiple replicates, conditions, and time points. Here we present a method to mine information from large-scale, heterogeneous phosphoproteomics datasets to rapidly generate robust targeted assays. We demonstrate the performance of our method by interrogating the IGF-1/AKT signaling pathway; and show that even rarely observed phosphorylation events can be consistently detected and precisely quantified.
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影响因子：
64.5
作者：
Huttlin EL;Jedrychowski MP;Elias JE;Goswami T;Rad R;Beausoleil SA;Villén J;Haas W;Sowa ME;Gygi SP
通讯作者：
Gygi SP
影响因子：
3.4
作者：
Eng, Jimmy K.;Jahan, Tahmina A.;Hoopmann, Michael R.
通讯作者：
Hoopmann, Michael R.
影响因子：
14.9
作者：
Hornbeck PV;Zhang B;Murray B;Kornhauser JM;Latham V;Skrzypek E
通讯作者：
Skrzypek E
影响因子：
7
作者：
de Graaf, Erik L.;Giansanti, Piero;Heck, Albert J. R.
通讯作者：
Heck, Albert J. R.
影响因子：
48
作者：
Tsou, Chih-Chiang;Avtonomov, Dmitry;Larsen, Brett;Tucholska, Monika;Choi, Hyungwon;Gingras, Anne-Claude;Nesvizhskii, Alexey I.
通讯作者：
Nesvizhskii, Alexey I.