Conformational change study of dengue virus NS2B-NS3 protease using 19F NMR spectroscopy.
Conformational change study of dengue virus NS2B-NS3 protease using 19F NMR spectroscopy.
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使用 19F NMR 光谱研究登革热病毒 NS2B-NS3 蛋白酶的构象变化。
DOI：
10.1016/j.bbrc.2015.04.090
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发表时间：
2015-06
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wang, Junfeng
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li, Hua;Sun, Hongbin;Liu, Jinsong;Wang, Junfeng
登革病毒NS2B-NS3蛋白酶(NS2B-NS3p)是抗病毒药物开发的重要靶点，据报道，NS2B-NS3p在具有不同NS2Bc定位的晶体结构中具有开放或封闭的构象。然而，在溶液中，NS2B-NS3P形成开放的、封闭的以及可能还有其他中间构象的混合物，这是传统的生物物理和生化技术难以表征的。在这项研究中，我们开发了一种新的策略来使用19F核磁共振波谱来分析这些构象变化。低pH或牛胰酶抑制物(BPTI)结合促进NS2Bc与NS3p的构象由开放向封闭转变，说明电荷力在NS2Bc与NS3p相互作用中的重要作用。突变H51a削弱了电荷相互作用和构象变化的pH依赖性。BPTI的加入稳定了NS2B-NS3p的开放构象，但仍使NS2B-NS3p从开放构象转化为闭合构象。
The dengue virus NS2B-NS3 protease (NS2B-NS3p), an important antiviral target for drug development, has been reported to adopt an open or closed conformation in crystal structures with different NS2B C-terminus (NS2Bc) positioning. In solution, nevertheless, NS2B-NS3p forms a mixture of open, closed and maybe other intermediate conformations, which is difficult to characterize using conventional biophysical and biochemical techniques. In this study, we developed a new strategy to analyze these conformational changes using19F NMR spectroscopy. Low pH or bovine pancreatic trypsin inhibitor (BPTI) binding promote the conformation change from open to closed, showing the importance of charge forces in the interaction between NS2Bc and NS3p. The mutation H51A impairs the charge interaction and the pH dependence of the conformational changes. It stabilizes the open conformation, while the addition of BPTI still converts NS2B-NS3p from open to closed conformation.
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影响因子：
--
作者：
Peter S. C. Wu;K. Ozawa;S. Lim;S. Vasudevan;N. Dixon;G. Otting
通讯作者：
Peter S. C. Wu;K. Ozawa;S. Lim;S. Vasudevan;N. Dixon;G. Otting
影响因子：
16.8
作者：
Erbel, P;Schiering, N;Hommel, U
通讯作者：
Hommel, U
影响因子：
3.9
作者：
M. Jacobs;P. Young
通讯作者：
M. Jacobs;P. Young
DOI：
10.1016/0006-291x(78)91435-3
发表时间：
1978-01-01
影响因子：
3.1
作者：
HUESTIS, WH;RAFTERY, MA
通讯作者：
RAFTERY, MA
影响因子：
8
作者：
Aleshin, Alexander E.;Shiryaev, Sergey A.;Liddington, Robert C.
通讯作者：
Liddington, Robert C.