Genome-Wide Analysis of Periodontal and Peri-Implant Cells and Tissues.
Genome-Wide Analysis of Periodontal and Peri-Implant Cells and Tissues.
复制标题
牙周和种植体周围细胞和组织的全基因组分析。
DOI：
10.1007/978-1-4939-6685-1_18
复制
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Papapanou,PanosN
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kebschull,Moritz;Hülsmann,Claudia;Hoffmann,Per;Papapanou,PanosN
组学分析，包括对细胞群体、器官或组织样本中的信使RNA和微RNA序列或DNA甲基化模式进行系统编目，是产生关于复杂疾病的全面基因组水平数据集的强大手段。我们对不同牙周病诊断实体的牙周组织的转录组、miRNome和甲基组进行了系统的研究，并对体外培养的原代细胞转录组以及感染牙周病原体后的转录组进行了研究。我们的数据进一步加深了我们对牙周疾病病理生物学的理解，并表明牙龈小体转化为可辨别的表型特征，并可能支持牙周炎的另一种“分子”分类。在这里，我们概述了使用当前微阵列或下一代测序技术处理牙周细胞和组织进行组学分析所需的实验室步骤。
Omics analyses, including the systematic cataloging of messenger RNA and microRNA sequences or DNA methylation patterns in a cell population, organ or tissue sample, are powerful means of generating comprehensive genome-level data sets on complex diseases. We have systematically assessed the transcriptome, miRNome and methylome of gingival tissues from subjects with different diagnostic entities of periodontal disease, and studied the transcriptome of primary cells ex vivo, or in vitro after infection with periodontal pathogens. Our data further our understanding of the pathobiology of periodontal diseases and indicate that the gingival -omes translate into discernible phenotypic characteristics and possibly support an alternative, “molecular” classification of periodontitis.Here, we outline the laboratory steps required for the processing of periodontal cells and tissues for -omics analyses using current microarrays or next-generation sequencing technology.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1016/s0736-5748(02)00041-2
发表时间：
2002-06-01
影响因子：
1.8
作者：
Haslett, JN;Kunkel, LM
通讯作者：
Kunkel, LM
DOI：
10.1056/nejmoa0804525
发表时间：
2008-11-06
期刊：
The New England journal of medicine
影响因子：
--
作者：
Hoshida Y;Villanueva A;Kobayashi M;Peix J;Chiang DY;Camargo A;Gupta S;Moore J;Wrobel MJ;Lerner J;Reich M;Chan JA;Glickman JN;Ikeda K;Hashimoto M;Watanabe G;Daidone MG;Roayaie S;Schwartz M;Thung S;Salvesen HB;Gabriel S;Mazzaferro V;Bruix J;Friedman SL;Kumada H;Llovet JM;Golub TR
通讯作者：
Golub TR
影响因子：
8.6
作者：
Thornton, S;Sowders, D;Hirsch, R
通讯作者：
Hirsch, R
风湿病学中的基因表达谱。
DOI：
--
发表时间：
2007
期刊：
Methods in Molecular Medicine
影响因子：
--
作者：
T. C. van der Pouw Kraan;L. V. van Baarsen;F. Rustenburg;B. Baltus;M. Fero;C. Verweij
通讯作者：
C. Verweij
影响因子：
7.6
作者：
Kebschull, M.;Guarnieri, P.;Papapanou, P. N.
通讯作者：
Papapanou, P. N.