The complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of Polythlipta liquidalis Leech, 1889 (Crambidae: spilomelinae).
The complete mitochondrial genome and phylogenetic analysis of Polythlipta liquidalis Leech, 1889 (Crambidae: spilomelinae).
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DOI：
10.1080/23802359.2023.2264548
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发表时间：
2023
影响因子：
0.5
通讯作者：
Rong, Hua
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yang, Lingdi;Wang, Ruihan;Zhang, Yanyao;Wang, Yu;Rong, Hua
本研究对Polythlipta liquidalis Leech， 1889的线粒体全基因组进行了测序和注释，这是首次报道的Polythlipta属完整的线粒体基因组。拟南棘有丝分裂基因组全长15305bp，编码37个典型线粒体基因，包括13个蛋白质编码基因（PCGs）、22个转移RNA基因（tRNAs）、2个核糖体RNA基因（rnas）和1个主要的非编码A-T富区。以玉米螟（Ostrinia furnacalis）为外类群，构建了13个聚类群的最大似然系统发育分析，其中包括liquidalis和15个相关的Spilomelinae种。结果表明，扁叶松属与斜叶松属。这些数据将作为一种分子资源，用于对麻蚶科成员进行遗传、功能、进化和比较基因组研究。
The complete mitochondrial genome of Polythlipta liquidalis Leech, 1889 was sequenced and annotated in this study, which was the first reported complete mitogenome of the genus Polythlipta. The mitogenome of P. liquidalis is 15,305 bp in length and was predicted to encode 37 typical mitochondrial genes including 13 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA genes (tRNAs), 2 ribosomal RNA genes (rRNAs), and one major non-coding A-T rich region. The maximum likelihood phylogenetic analysis based on the 13 PCGs was constructed, including P. liquidalis and 15 related Spilomelinae species, using Ostrinia furnacalis as the outgroup. The result showed that P. liquidalis is grouped with Sinomphisa plagialis. These data will serve as a molecular resource for species identification of P. liquidalis and become a valuable resource for a range of genetic, functional, evolutionary and comparative genomic studies on members of Spilomelinae.
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