Processing and population genetic analysis of multigenic datasets with ProSeq3 software.
Processing and population genetic analysis of multigenic datasets with ProSeq3 software.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btp572
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发表时间：
2009-12-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Filatov DA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Filatov DA
动机：目前分子群体遗传学的趋势是在分析中使用越来越多的基因。在这里，我描述了一个程序，用于处理从多个基因收集的DNA多态数据并进行群体遗传分析。该程序包括一个序列/比对编辑器和一个内部关系数据库，简化了多基因DNA多态数据集的准备和操作。最常用的DNA多态分析是在ProSeq3中实现的，便于对大型多基因数据集进行群体遗传分析。丰富的输入/输出选项使ProSeq3成为处理和分析序列数据的便捷枢纽。提供：该计划可从http://dps.plants.ox.ac.uk/sequencing/proseq.htm免费获得联系方式：dmitry.filatov@ants s.ox.ac.uk
Motivation: The current tendency in molecular population genetics is to use increasing numbers of genes in the analysis. Here I describe a program for handling and population genetic analysis of DNA polymorphism data collected from multiple genes. The program includes a sequence/alignment editor and an internal relational database that simplify the preparation and manipulation of multigenic DNA polymorphism datasets. The most commonly used DNA polymorphism analyses are implemented in ProSeq3, facilitating population genetic analysis of large multigenic datasets. Extensive input/output options make ProSeq3 a convenient hub for sequence data processing and analysis. Availability: The program is available free of charge from http://dps.plants.ox.ac.uk/sequencing/proseq.htm Contact: dmitry.filatov@plants.ox.ac.uk
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DOI：
10.1046/j.1471-8286.2002.00313.x
发表时间：
2002-12-01
期刊：
MOLECULAR ECOLOGY NOTES
影响因子：
--
作者：
Filatov, DA
通讯作者：
Filatov, DA
影响因子：
10.7
作者：
Foxe, John Paul;Dar, Vaqaar-un-Nisa;Wright, Stephen I.
通讯作者：
Wright, Stephen I.
种群基因组学：果蝇果蝇中多态性和差异的全基因组分析。
影响因子：
9.8
作者：
Begun, David J.;Holloway, Alisha K.;Stevens, Kristian;Hillier, LaDeana W.;Poh, Yu-Ping;Hahn, Matthew W.;Nista, Phillip M.;Jones, Corbin D.;Kern, Andrew D.;Dewey, Colin N.;Pachter, Lior;Myers, Eugene;Langley, Charles H.
通讯作者：
Langley, Charles H.
影响因子：
2.6
作者：
Excoffier, Laurent;Laval, Guillaume;Schneider, Stefan
通讯作者：
Schneider, Stefan
DOI：
10.1073/pnas.0611164104
发表时间：
2007-02-20
影响因子：
11.1
作者：
Hey, Jody;Nielsen, Rasmus
通讯作者：
Nielsen, Rasmus