DNA barcoding Satyrine butterflies (Lepidoptera: Nymphalidae) in China
DNA barcoding Satyrine butterflies (Lepidoptera: Nymphalidae) in China
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中国的 DNA 条形码 Satyrine 蝴蝶（鳞翅目：蛱蝶科）
DOI：
10.3109/19401736.2015.1038788
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发表时间：
2016-07
影响因子：
--
通讯作者：
Yalin Zhang
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mingsheng Yang;Qing Zhai;Zhaofu Yang;Yalin Zhang
我们研究了标准 648bp 线粒体 COI 条形码区域在区分来自中国的 Satyrine 物种方面的有效性。从 90 个物种中总共获得了 214 个 COI 序列，其中包括 34 个从未被加条形码的物种。遗传分化分析表明，种间遗传分化平均约为种内遗传分化的16倍，且种间遗传分化很少发生重叠。邻接 (NJ) 分析表明，50 个具有两个或多个个体的物种中，有 48 个是单系的，其中包括两个具有深度种内分化 (>3%) 的案例。此外，当我们的序列与从遥远地理区域采样的同种序列组合时，“条形码间隙”仍然存在，并且所有相关物种在新泽西州分析中都恢复为单系。我们的研究表明COI条形码可以有效区分中国的色鳖属物种，并为其未来的分子鉴定提供参考库。
We investigated the effectiveness of the standard 648 bp mitochondrial COI barcode region in discriminating among Satyrine species from China. A total of 214 COI sequences were obtained from 90 species, including 34 species that have never been barcoded. Analyses of genetic divergence show that the mean interspecific genetic divergence is about 16-fold higher than within species, and little overlap occurs between them. Neighbour-joining (NJ) analyses showed that 48 of the 50 species with two or more individuals, including two cases with deep intraspecific divergence (>3%), are monophyletic. Furthermore, when our sequences are combined with the conspecific sequences sampled from distantly geographic regions, the “barcoding gap” still exists, and all related species are recovered to be monophyletic in NJ analysis. Our study demonstrates that COI barcoding is effective in discriminating among the satyrine species of China, and provides a reference library for their future molecular identification.
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DOI：
10.1098/rsbl.2003.0025
发表时间：
2003-08-07
影响因子：
4.7
作者：
Hebert, PDN;Ratnasingham, S;deWaard, JR
通讯作者：
deWaard, JR
影响因子：
9.8
作者：
Hebert PD;Stoeckle MY;Zemlak TS;Francis CM
通讯作者：
Francis CM
影响因子：
3.3
作者：
Pena, Carlos;Wahlberg, Niklas
通讯作者：
Wahlberg, Niklas
DOI：
10.1098/rstb.2005.1716
发表时间：
2005-10-29
影响因子：
6.3
作者：
Ward, RD;Zemlak, TS;Hebert, PDN
通讯作者：
Hebert, PDN
影响因子：
1.9
作者：
Brown, B;Emberson, RM;Paterson, AM
通讯作者：
Paterson, AM