COPASI and its applications in biotechnology.

COPASI and its applications in biotechnology.
复制标题

DOI:
10.1016/j.jbiotec.2017.06.1200
复制
发表时间:
2017-11-10
影响因子:
4.1
通讯作者:
Sahle S
Sahle S
中科院分区:
工程技术3区
文献类型:
--
作者:
Bergmann FT;Hoops S;Klahn B;Kummer U;Mendes P;Pahle J;Sahle S

文献摘要

参考文献

被引文献

相似文献

COPASI是用于创建、修改、模拟和计算分析各个领域动力学模型的软件。它是开源的,可用于所有主要平台,并提供用户友好的图形用户界面,但也可以通过命令行和脚本语言进行控制。这些可能是它被广泛接受的原因。我们开始这篇评论与一个简短的介绍,描述在生物科学中的计算建模的一般方法和技术。接下来,我们将介绍COPASI软件包及其功能,然后再介绍COPASI在生物技术中的典型应用。
COPASI is software used for the creation, modification, simulation and computational analysis of kinetic models in various fields. It is open-source, available for all major platforms and provides a user-friendly graphical user interface, but is also controllable via the command line and scripting languages. These are likely reasons for its wide acceptance. We begin this review with a short introduction describing the general approaches and techniques used in computational modeling in the biosciences. Next we introduce the COPASI package, and its capabilities, before looking at typical applications of COPASI in biotechnology.
DOI: 10.1093/bioinformatics/btg015
发表时间: 2003-03-01
期刊: BIOINFORMATICS
影响因子: 5.8
作者:
Hucka, M;Finney, A;Wang, J
通讯作者: Wang, J
DOI: 10.1063/1.2159468
发表时间: 2006-01-28
影响因子: 4.4
作者:
Cao, Y;Gillespie, DT;Petzold, LR
通讯作者: Petzold, LR
DOI: 10.1145/321062.321069
发表时间: 1961-01-01
期刊: JOURNAL OF THE ACM
影响因子: 2.5
作者:
HOOKE, R;JEEVES, TA
通讯作者: JEEVES, TA
DOI: 10.1088/1742-5468/2012/11/p11010
发表时间: 2012-11-01
影响因子: 2.4
作者:
Challenger, Joseph D.;McKane, Alan J.;Pahle, Juergen
通讯作者: Pahle, Juergen
DOI: 10.1016/0021-9991(76)90041-3
发表时间: 1976-01-01
影响因子: 4.1
作者:
GILLESPIE, DT
通讯作者: GILLESPIE, DT