The complete chloroplast genome of Camellia osmantha, an edible oil Camellia.
The complete chloroplast genome of Camellia osmantha, an edible oil Camellia.
复制标题
DOI：
10.1080/23802359.2021.1987169
复制
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Jia X
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu Y;Xu Y;Jia X
桂花山茶（Camellia osmantha）是2012年在广西南宁发现的山茶属一新种。可作为一种优良的木本油料作物。国内外对该物种的相关研究较少，其基因组信息尚缺乏。本研究对中国对虾的叶绿体基因组全序列进行了测定。桂花属首次报道（GenBank登录号：MZ 128138）。叶绿体基因组全长156，981 bp，GC含量为37.28%，由86，647 bp的大单拷贝（LSC）区、18，284 bp的小单拷贝（SSC）区和一对各26，025 bp的反向重复（IR）区组成。基因组包含135个功能基因，包括37个转运RNA基因、90个蛋白质编码基因和8个核糖体RNA基因。基于21个叶绿体基因组的最大似然分析表明，C。osmantha和C. oleifera（MF541730.2）的亲缘关系最近。
Camellia osmantha is a new species of the Camellia genus discovered in Nanning, Guangxi, China, in 2012. It can be used as an excellent woody oil crop. There is little related research on this species in China and abroad, and its genome information is still lacking. In this study, the complete chloroplast genome sequence of C. osmantha was first reported (GenBank number: MZ128138). The whole chloroplast genome is 156,981 bp in length with a GC content of 37.28%, and it is composed of a large single copy (LSC) region of 86,647 bp, a small single copy (SSC) region of 18,284 bp, and a pair of inverted repeat (IR) regions of 26,025 bp each. The genome contains a total of 135 functional genes, including 37 transfer RNA genes, 90 protein-coding genes, and 8 ribosomal RNA genes. The maximum likelihood analysis based on 21 chloroplast genomes showed that C. osmantha and C. oleifera (MF541730.2) were the most closely related.
登录
查看更多内容
GESEQ-细胞器基因组的多功能和准确注释。
影响因子：
14.9
作者：
Tillich M;Lehwark P;Pellizzer T;Ulbricht-Jones ES;Fischer A;Bock R;Greiner S
通讯作者：
Greiner S
影响因子：
2.2
作者：
Ouyang, Xi-Lin;Yang, Li;Pan, Ying-Ming
通讯作者：
Pan, Ying-Ming
CpGAVAS，一个集成的网络服务器，用于注释、可视化、分析和 GenBank 提交完整测序的叶绿体基因组序列
影响因子：
4.4
作者：
Liu C;Shi L;Zhu Y;Chen H;Zhang J;Lin X;Guan X
通讯作者：
Guan X
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu033
发表时间：
2014-05-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Stamatakis A
通讯作者：
Stamatakis A
影响因子：
3.7
作者：
Xia EH;Jiang JJ;Huang H;Zhang LP;Zhang HB;Gao LZ
通讯作者：
Gao LZ