Panhematopoietic RNA barcoding enables kinetic measurements of nucleate and anucleate lineages and the activation of myeloid clones following acute platelet depletion.
Panhematopoietic RNA barcoding enables kinetic measurements of nucleate and anucleate lineages and the activation of myeloid clones following acute platelet depletion.
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DOI：
10.1186/s13059-023-02976-z
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发表时间：
2023-06-27
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
血小板和红细胞占所有造血干细胞输出的95%以上。然而，HSC对这些谱系的贡献的克隆动力学在很大程度上仍未被探索。我们使用小鼠造血干细胞的慢病毒遗传标记来量化所有谱系、有核细胞和无核细胞的输出，同时使用单细胞RNA测序将这些与干细胞和祖细胞转录组学表型联系起来。我们观察到动态变化的克隆行为，随着时间的推移，在同一动物的外周血和证明，急性血小板耗竭转移输出的多能造血干细胞的血小板的独家生产。此外，我们观察到新的骨髓偏向性克隆的出现，这些克隆支持血细胞的短期和长期生产。我们的方法使动力学研究的多谱系输出在外周血和转录异质性的个体造血干细胞。我们的研究结果提供了一个独特的见解造血干细胞活化血小板耗竭后，在稳态和压力下的克隆动力学。在线版本包含补充材料，可通过10.1186/s13059-023-02976-z获得。
Platelets and erythrocytes constitute over 95% of all hematopoietic stem cell output. However, the clonal dynamics of HSC contribution to these lineages remains largely unexplored. We use lentiviral genetic labeling of mouse hematopoietic stem cells to quantify output from all lineages, nucleate, and anucleate, simultaneously linking these with stem and progenitor cell transcriptomic phenotypes using single-cell RNA-sequencing. We observe dynamic shifts of clonal behaviors through time in same-animal peripheral blood and demonstrate that acute platelet depletion shifts the output of multipotent hematopoietic stem cells to the exclusive production of platelets. Additionally, we observe the emergence of new myeloid-biased clones, which support short- and long-term production of blood cells. Our approach enables kinetic studies of multi-lineage output in the peripheral blood and transcriptional heterogeneity of individual hematopoietic stem cells. Our results give a unique insight into hematopoietic stem cell reactivation upon platelet depletion and of clonal dynamics in both steady state and under stress. The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13059-023-02976-z.
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影响因子：
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作者：
Ferrari S;Jacob A;Beretta S;Unali G;Albano L;Vavassori V;Cittaro D;Lazarevic D;Brombin C;Cugnata F;Kajaste-Rudnitski A;Merelli I;Genovese P;Naldini L
通讯作者：
Naldini L
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作者：
Dykstra, Brad;Kent, David;Eaves, Connie
通讯作者：
Eaves, Connie
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Georgiades, P;Ogilvy, S;Print, CG
通讯作者：
Print, CG
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作者：
Belderbos, Mirjam E.;Koster, Taco;Bystrykh, Leonid V.
通讯作者：
Bystrykh, Leonid V.
记忆B细胞群体的细胞动力学：IgM+和IgG+存储B细胞无限期地作为静态细胞。
DOI：
10.4049/jimmunol.1501365
发表时间：
2015-11-15
期刊：
Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
影响因子：
--
作者：
Jones DD;Wilmore JR;Allman D
通讯作者：
Allman D