Characterization of a chlorella virus PBCV-1 encoded ribonuclease III.
Characterization of a chlorella virus PBCV-1 encoded ribonuclease III.
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小球藻病毒 PBCV-1 编码核糖核酸酶 III 的表征。
DOI：
10.1016/j.virol.2003.08.044
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发表时间：
2003
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
VanEtten,JamesL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang,Yuanzheng;Calin-Jageman,Irina;Gurnon,JamesR;Choi,Tae-Jin;Adams,Byron;Nicholson,AllenW;VanEtten,JamesL
对小球藻病毒 PBCV-1 330 kb 基因组的序列分析揭示了一个开放阅读框 A464R，它编码的蛋白质与许多细菌的核糖核酸酶 III (RNase III) 具有 30-35% 的氨基酸同一性。克隆了 a464r 基因，并使用几丁质结合内含肽系统在大肠杆菌中表达该蛋白质。重组 PBCV-1 RNase III 以 Mg2+ 依赖性方式将模型 dsRNA 底物裂解为一组确定的产物。底物裂解特异性与大肠杆菌 RNase III 重叠，但不相同。 a464r 基因在 PBCV-1 感染过程中很早就表达，即注射后 5-10 分钟内。 RNase III 蛋白在注射后 15 分钟出现。并于 120 分钟后消失a464r 基因在小球藻病毒中高度保守。系统发育分析表明，PBCV 酶与肺炎支原体 RNase III 关系最密切。
Sequence analysis of the 330-kb genome of chlorella virus PBCV-1 revealed an open reading frame, A464R, which encodes a protein with 30–35% amino acid identity to ribonuclease III (RNase III) from many bacteria. The a464r gene was cloned and the protein was expressed in Escherichia coli using the chitin-binding intein system. The recombinant PBCV-1 RNase III cleaves model dsRNA substrates, in a Mg2+-dependent manner, into a defined set of products. The substrate cleavage specificity overlaps, but is nonidentical to that of E. coli RNase III. The a464r gene is expressed very early during PBCV-1 infection, within 5–10 min p.i. The RNase III protein appears at 15 min p.i. and disappears by 120 min p.i. The a464r gene is highly conserved among the chlorella viruses. Phylogenetic analyses indicate that the PBCV enzyme is most closely related to Mycoplasma pneumoniae RNase III.
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