The DNA binding arm of lambda repressor: critical contacts from a flexible region.
The DNA binding arm of lambda repressor: critical contacts from a flexible region.
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lambda 阻遏物的 DNA 结合臂：来自柔性区域的关键接触。
DOI：
10.1126/science.254.5029.267
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发表时间：
1991
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Pabo,CO
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Clarke,ND;Beamer,LJ;Goldberg,HR;Berkower,C;Pabo,CO
在没有DNA的情况下，不采用有序构象的蛋白质片段仍然有助于DNA的位点特异性识别。噬菌体Lambda抑制子的前六个残基(NH2-Ser1-Thr2-Lys3-Lys4-Lys5-Pro6-)是灵活的，但对于位点特异性结合是重要的。采用低温X射线结晶学和密码子定向饱和诱变的方法研究该片段的作用。所有的功能序列都具有[X]1-[X]2-[Lys或Arg]3-[Lys]4-[Lys或Arg]5-[X]6的形式。高分辨(1.8埃)晶体结构表明，Lys3和Lys4分别与鸟嘌呤形成多个氢键，Lys5与磷酸骨架相互作用。复合体的对称性在站点中心附近被破坏，这些结果表明对六个Lambda操作中心的传统比对进行了修改。
Segments of protein that do not adopt a well-ordered conformation in the absence of DNA can still contribute to site-specific recognition of DNA. The first six residues (NH2-Ser1-Thr2-Lys3-Lys4-Lys5-Pro6-) of phage lambda repressor are flexible but are important for site-specific binding. Low-temperature x-ray crystallography and codondirected saturation mutagenesis were used to study the role of this segment. All of the functional sequences have the form [X]1-[X]2-[Lys or Arg]3-[Lys]4-[Lys or Arg]5-[X]6. A high-resolution (1.8 angstrom) crystal structure shows that Lys3 and Lys4 each make multiple hydrogen bonds with guanines and that Lys5 interacts with the phosphate backbone. The symmetry of the complex breaks down near the center of the site, and these results suggest a revision in the traditional alignment of the six lambda operator sites.
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