Secondary Structure of Subgenomic RNA M of SARS-CoV-2.
Secondary Structure of Subgenomic RNA M of SARS-CoV-2.
复制标题
DOI：
10.3390/v14020322
复制
发表时间：
2022-02-04
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Kierzek E
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Soszynska-Jozwiak M;Ruszkowska A;Kierzek R;O'Leary CA;Moss WN;Kierzek E
SARS-CoV-2属于冠状病毒科。与其他冠状病毒一样，SARS-CoV-2有包膜，具有约30 kb的正义单链RNA基因组。基因组RNA用作复制和转录的模板。在这些过程中，产生了正义基因组RNA（gRNA）和亚基因组RNA（sgRNA）。几项研究提出了基因组RNA二级结构在SARS-CoV-2复制中的重要性。然而，迄今为止，sgRNA的结构在很大程度上仍未得到解决。在本研究中，我们探索了SARS-CoV-2的sgRNA M体外模型。该模型分子包括M基因的5′UTR和编码序列。这是第一个通过实验获得的sgRNA M的二级结构模型，它呈现了可能在sgRNA M功能中很重要的特征。sgRNA M结构的知识为更好地理解病毒生物学提供了见解，并可用于设计新的治疗方法。
SARS-CoV-2 belongs to the Coronavirinae family. Like other coronaviruses, SARS-CoV-2 is enveloped and possesses a positive-sense, single-stranded RNA genome of ~30 kb. Genomic RNA is used as the template for replication and transcription. During these processes, positive-sense genomic RNA (gRNA) and subgenomic RNAs (sgRNAs) are created. Several studies presented the importance of the genomic RNA secondary structure in SARS-CoV-2 replication. However, the structure of sgRNAs has remained largely unsolved so far. In this study, we probed the sgRNA M model of SARS-CoV-2 in vitro. The presented model molecule includes 5′UTR and a coding sequence of gene M. This is the first experimentally informed secondary structure model of sgRNA M, which presents features likely to be important in sgRNA M function. The knowledge of sgRNA M structure provides insights to better understand virus biology and could be used for designing new therapeutics.
登录
查看更多内容
影响因子：
16
作者：
Huston NC;Wan H;Strine MS;de Cesaris Araujo Tavares R;Wilen CB;Pyle AM
通讯作者：
Pyle AM
地狱1.1：RNA同源性搜索速度更快100倍。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btt509
发表时间：
2013-11-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Nawrocki EP;Eddy SR
通讯作者：
Eddy SR
影响因子：
9.5
作者：
Katoh K;Rozewicki J;Yamada KD
通讯作者：
Yamada KD
影响因子：
8.8
作者：
Cid-Samper, Fernando;Gelabert-Baldrich, Mariona;Gaetano Tartaglia, Gian
通讯作者：
Gaetano Tartaglia, Gian
影响因子：
4.5
作者：
Karabiber, Fethullah;McGinnis, Jennifer L.;Weeks, Kevin M.
通讯作者：
Weeks, Kevin M.