Spectroscopic, viscositic and molecular modeling studies on the interaction of 3'-azido-daunorubicin thiosemicarbazone with DNA.
Spectroscopic, viscositic and molecular modeling studies on the interaction of 3'-azido-daunorubicin thiosemicarbazone with DNA.
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DOI：
10.1007/s10895-013-1285-8
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发表时间：
2014-01
影响因子：
2.7
通讯作者：
Zhang, Guisheng
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cui, Fengling;Liu, Qingfeng;Luo, Hongxia;Zhang, Guisheng
合成了一种新的柔红霉素，并对其结构进行了表征。在模拟生理条件下，采用多光谱技术、粘度测量和分子模拟研究了小牛胸腺DNA（ctDNA）与3′-叠氮柔红霉素缩氨基硫脲（ADNRT）的相互作用.结论：ADNRT可嵌入ctDNA的碱基对中，ctDNA对ADNRT的荧光猝灭为静态猝灭。热力学参数表明，ADNRT与ctDNA的结合主要是由疏水相互作用驱动的。随着ADNRT的加入，ctDNA的相对粘度增加，证实了插入方式。此外，分子模拟研究证实了上述实验结果。
A new daunorubicin has been synthesized and structurally characterized. The interaction of native calf thymus DNA (ctDNA) with 3′-azido-daunorubicin thiosemicarbazone (ADNRT) was investigated under simulated physiological conditions by multi-spectroscopic techniques, viscometric measurements and molecular modeling study. It concluded that ADNRT could intercalate into the base pairs of ctDNA, and the fluorescence quenching by ctDNA was static quenching type. Thermodynamic parameters calculated suggested that the binding of ADNRT to ctDNA was mainly driven by hydrophobic interactions. The relative viscosity of ctDNA increased with the addition of ADNRT, which confirmed the intercalation mode. Furthermore, molecular modeling studies corroborate the above experimental results.
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