Structural insights into the mycobacteria transcription initiation complex from analysis of X-ray crystal structures.
Structural insights into the mycobacteria transcription initiation complex from analysis of X-ray crystal structures.
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DOI：
10.1038/ncomms16072
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发表时间：
2017-07-13
影响因子：
16.6
通讯作者：
Campbell EA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hubin EA;Lilic M;Darst SA;Campbell EA
分枝杆菌 RNA 聚合酶 (RNAP) 是抗结核抗菌药物的靶标，促进了结构/功能研究。在这里，我们报告了耻垢分枝杆菌 (Msm) 开放启动子复合物 (RPo) 的 3.2 Å 分辨率晶体结构，以及 Msm RPo 的结构分析，以及之前报道的带有启动子 DNA 片段的 Msm 转录起始复合物的 2.76 Å 分辨率晶体结构。我们观察了 Msm RNAP α 亚基 C 端结构域 (αCTD) 与 DNA 的相互作用，并提供了 αCTD 可能在 Mtb 转录调控中发挥作用的证据。我们的结果揭示了放线菌独特的 RNAP β' 亚基插入片段的结构。最后，我们的分析揭示了 Msm σA N 端片段的配置，它可能包含分枝杆菌特有的本质上无序的蛋白质结构域。分枝杆菌 RNAP 的进化枝特异性特征为分枝杆菌 RPo 与大肠杆菌相比的高度不稳定性提供了线索。了解分枝杆菌转录系统有助于开发抗结核感染的疗法。在这里，作者展示了完整的耻垢分枝杆菌 RNA 聚合酶开放启动子复合物的晶体结构，揭示了分枝杆菌聚合酶的独特特征。
The mycobacteria RNA polymerase (RNAP) is a target for antimicrobials against tuberculosis, motivating structure/function studies. Here we report a 3.2 Å-resolution crystal structure of a Mycobacterium smegmatis (Msm) open promoter complex (RPo), along with structural analysis of the Msm RPo and a previously reported 2.76 Å-resolution crystal structure of an Msm transcription initiation complex with a promoter DNA fragment. We observe the interaction of the Msm RNAP α-subunit C-terminal domain (αCTD) with DNA, and we provide evidence that the αCTD may play a role in Mtb transcription regulation. Our results reveal the structure of an Actinobacteria-unique insert of the RNAP β′ subunit. Finally, our analysis reveals the disposition of the N-terminal segment of Msm σA, which may comprise an intrinsically disordered protein domain unique to mycobacteria. The clade-specific features of the mycobacteria RNAP provide clues to the profound instability of mycobacteria RPo compared with E. coli. Understanding of the mycobacterial transcription system is useful to the development of therapeutics against tuberculosis infection. Here the authors present the crystal structure of a complete M. smegmatis RNA polymerase open promoter complex that reveals unique features of the mycobacterial polymerase.
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影响因子：
14.9
作者：
Davis E;Chen J;Leon K;Darst SA;Campbell EA
通讯作者：
Campbell EA
影响因子：
64.5
作者：
Feklistov A;Darst SA
通讯作者：
Darst SA
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
16
作者：
Feklistov, Andrey;Barinova, Nataliya;Kulbachinskiy, Andrey
通讯作者：
Kulbachinskiy, Andrey
影响因子：
6.4
作者：
Czyz A;Mooney RA;Iaconi A;Landick R
通讯作者：
Landick R