CRISPR C-to-G base editors for inducing targeted DNA transversions in human cells.
CRISPR C-to-G base editors for inducing targeted DNA transversions in human cells.
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DOI：
10.1038/s41587-020-0609-x
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发表时间：
2021-01
影响因子：
46.9
通讯作者：
Joung JK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kurt IC;Zhou R;Iyer S;Garcia SP;Miller BR;Langner LM;Grünewald J;Joung JK
CRISPR引导的DNA胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑器（CBE和ABE）广泛用于许多应用，但主要产生DNA碱基转换（即，嘧啶到嘧啶或嘌呤到嘌呤）。在这里，我们描述了两个碱基编辑器架构的工程设计，其可以有效地诱导靶向的C至G碱基颠换，同时降低不需要的C至W（W = A或T）和插入缺失突变的水平。这些C-to-G碱基编辑器之一（CGBE 1）由RNA引导的Cas9切口酶、E.大肠杆菌衍生的尿嘧啶DNA N-糖基化酶（eUNG）和大鼠APOBEC 1胞苷脱氨酶变体（R33 A），先前显示具有降低的脱靶RNA和DNA编辑活性。我们发现CGBE 1可以有效地诱导C到G编辑，特别是在人类细胞中富含AT的序列背景下。我们还去除了eUNG结构域以产生miniCGBE 1，这降低了插入缺失频率，但仅适度降低了编辑效率。CGBE 1和miniCGBE 1实现了C-to-G编辑，并将作为优化C-to-G基础编辑器的基础，用于研究和治疗应用。一种新的碱基编辑器可以在人类细胞中创建C到G碱基的变化。
CRISPR-guided DNA cytosine and adenine base editors (CBEs and ABEs) are widely used for many applications but primarily create DNA base transitions (i.e., pyrimidine-to-pyrimidine, or purine-to-purine). Here we describe the engineering of two base editor architectures that can efficiently induce targeted C-to-G base transversions, with reduced levels of unwanted C-to-W (W = A or T) and indel mutations. One of these C-to-G base editors (CGBE1), consists of an RNA-guided Cas9 nickase, an E. coli-derived uracil DNA N-glycosylase (eUNG), and a rat APOBEC1 cytidine deaminase variant (R33A) previously shown to have reduced off-target RNA and DNA editing activities. We show that CGBE1 can efficiently induce C-to-G edits, particularly in AT-rich sequence contexts in human cells. We also removed the eUNG domain to yield miniCGBE1, which reduced indel frequencies but only modestly decreased editing efficiency. CGBE1 and miniCGBE1 enable C-to-G edits and will serve as a basis for optimizing C-to-G base editors for research and therapeutic applications. A new base editor enables the creation of C-to-G base changes in human cells.
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影响因子：
46.9
作者：
Kim YB;Komor AC;Levy JM;Packer MS;Zhao KT;Liu DR
通讯作者：
Liu DR
影响因子：
46.9
作者：
Tsai, Shengdar Q.;Zheng, Zongli;Nguyen, Nhu T.;Liebers, Matthew;Topkar, Ved V.;Thapar, Vishal;Wyvekens, Nicolas;Khayter, Cyd;Iafrate, A. John;Le, Long P.;Aryee, Martin J.;Joung, J. Keith
通讯作者：
Joung, J. Keith
影响因子：
64.8
作者：
Komor AC;Kim YB;Packer MS;Zuris JA;Liu DR
通讯作者：
Liu DR
通过表达优化和祖先重建改进胞苷和腺嘌呤碱基编辑器。
影响因子：
46.9
作者：
Koblan LW;Doman JL;Wilson C;Levy JM;Tay T;Newby GA;Maianti JP;Raguram A;Liu DR
通讯作者：
Liu DR
DOI：
10.1126/science.aas9129
发表时间：
2018-09-21
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Nishimasu H;Shi X;Ishiguro S;Gao L;Hirano S;Okazaki S;Noda T;Abudayyeh OO;Gootenberg JS;Mori H;Oura S;Holmes B;Tanaka M;Seki M;Hirano H;Aburatani H;Ishitani R;Ikawa M;Yachie N;Zhang F;Nureki O
通讯作者：
Nureki O