Pentacyclic adenine: a versatile and exceptionally bright fluorescent DNA base analogue.
Pentacyclic adenine: a versatile and exceptionally bright fluorescent DNA base analogue.
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DOI：
10.1039/c7sc05448c
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发表时间：
2018-04-14
期刊：
影响因子：
8.4
通讯作者：
Grøtli M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bood M;Füchtbauer AF;Wranne MS;Ro JJ;Sarangamath S;El-Sagheer AH;Rupert DLM;Fisher RS;Magennis SW;Jones AC;Höök F;Brown T;Kim BH;Dahlén A;Wilhelmsson LM;Grøtli M
设计、合成了一种高荧光、无干扰的五环腺嘌呤类似物，并将其掺入DNA中，进行了生物物理学评价。发射碱基类似物是在分子水平上探测核酸的有力工具。在这里，我们描述了五环腺嘌呤（PA），一个通用的基础类似物具有特殊的荧光特性的发展和彻底的表征。当掺入DNA中时，pA选择性地与胸腺嘧啶配对而不干扰B型结构，并且是迄今为止报道的最亮的核碱基类似物之一。与最近建立的基础类似物受体qAnitro一起，pA可以通过Förster共振能量转移（FRET）测量精确的距离和方向确定。在高于400 nm的发射波长处的高亮度也使其适用于荧光显微术，如通过使用全内反射荧光显微术对涂覆有胆固醇锚定的pA-dsDNA的单个脂质体构建体进行成像所证明的。最后，pA也非常有希望用于780 nm处的双光子激发，其亮度（5.3 GM）对于基础类似物来说是前所未有的。
A highly fluorescent, non-perturbing, pentacyclic adenine analog was designed, synthesized, incorporated into DNA and photophysical evaluated. Emissive base analogs are powerful tools for probing nucleic acids at the molecular level. Herein we describe the development and thorough characterization of pentacyclic adenine (pA), a versatile base analog with exceptional fluorescence properties. When incorporated into DNA, pA pairs selectively with thymine without perturbing the B-form structure and is among the brightest nucleobase analogs reported so far. Together with the recently established base analog acceptor qAnitro, pA allows accurate distance and orientation determination via Förster resonance energy transfer (FRET) measurements. The high brightness at emission wavelengths above 400 nm also makes it suitable for fluorescence microscopy, as demonstrated by imaging of single liposomal constructs coated with cholesterol-anchored pA–dsDNA, using total internal reflection fluorescence microscopy. Finally, pA is also highly promising for two-photon excitation at 780 nm, with a brightness (5.3 GM) that is unprecedented for a base analog.
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影响因子：
48
作者：
Dempsey, Graham T.;Vaughan, Joshua C.;Chen, Kok Hao;Bates, Mark;Zhuang, Xiaowei
通讯作者：
Zhuang, Xiaowei
两光子诱导的异构核酶类似物的荧光。
DOI：
10.1002/cphc.201400031
发表时间：
2014-04-04
期刊：
Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
影响因子：
--
作者：
Lane RS;Jones R;Sinkeldam RW;Tor Y;Magennis SW
通讯作者：
Magennis SW
影响因子：
14.9
作者：
Datta, Kausiki;Johnson, Neil P.;von Hippel, Peter H.
通讯作者：
von Hippel, Peter H.
影响因子：
4.3
作者：
Dumat, Blaise;Bood, Mattias;Wilhelmsson, L. Marcus
通讯作者：
Wilhelmsson, L. Marcus
影响因子：
2.9
作者：
Hawkins, ME;Pfleiderer, W;Knutson, JR
通讯作者：
Knutson, JR