What sequencing technologies can teach us about innate immunity.
What sequencing technologies can teach us about innate immunity.
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DOI：
10.1111/imr.13033
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发表时间：
2022-01
影响因子：
8.7
通讯作者：
Carpenter S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mohammed Salih M;Carpenter S
多年来，我们一直采用还原论方法，通过一次研究一个细胞中的一个基因来理解基因调控。虽然这种方法卓有成效，但很费力，并且无法提供涉及紧密协调免疫反应的复杂情况下所发生情况的全局图景。全基因组技术的出现提供了反应的系统水平视图，并且可以提供关于细胞中发生的事件的大量信息，从基因表达变化到剪接变化和化学修饰。与任何技术一样，这通常会带来更多的问题而不是答案，但这些丰富的知识为我们提供了关于免疫反应期间细胞内发生的情况的前所未有的视角。在这篇综述中，我们将讨论当前的 RNA 测序技术以及它们如何帮助我们了解先天免疫系统。
For years we have taken a reductionist approach to understanding gene regulation through the study of one gene in one cell at a time. While this approach has been fruitful it is laborious and fails to provide a global picture of what is occurring in complex situations involving tightly coordinated immune responses. The emergence of whole genome techniques provides a system level view of a response and can provide a plethora of information on events occurring in a cell from gene expression changes to splicing changes and chemical modifications. As with any technology this often results in more questions than answers, but this wealth of knowledge is providing us with an unprecedented view of what occurs inside our cells during an immune response. In this review we will discuss the current RNA-sequencing technologies and what they are helping us learn about the innate immune system.
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影响因子：
64.8
作者：
Carrieri, Claudia;Cimatti, Laura;Gustincich, Stefano
通讯作者：
Gustincich, Stefano
影响因子：
3.7
作者：
Abi-Rached L;Gouret P;Yeh JH;Di Cristofaro J;Pontarotti P;Picard C;Paganini J
通讯作者：
Paganini J
DOI：
10.1126/science.1240925
发表时间：
2013-08-16
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Carpenter S;Aiello D;Atianand MK;Ricci EP;Gandhi P;Hall LL;Byron M;Monks B;Henry-Bezy M;Lawrence JB;O'Neill LA;Moore MJ;Caffrey DR;Fitzgerald KA
通讯作者：
Fitzgerald KA
DOI：
10.1084/jem.20141441
发表时间：
2015-03-09
期刊：
The Journal of experimental medicine
影响因子：
--
作者：
Breton G;Lee J;Zhou YJ;Schreiber JJ;Keler T;Puhr S;Anandasabapathy N;Schlesinger S;Caskey M;Liu K;Nussenzweig MC
通讯作者：
Nussenzweig MC
影响因子：
64.5
作者：
Atianand MK;Hu W;Satpathy AT;Shen Y;Ricci EP;Alvarez-Dominguez JR;Bhatta A;Schattgen SA;McGowan JD;Blin J;Braun JE;Gandhi P;Moore MJ;Chang HY;Lodish HF;Caffrey DR;Fitzgerald KA
通讯作者：
Fitzgerald KA