Single-cell genomics in plants: current state, future directions, and hurdles to overcome.
Single-cell genomics in plants: current state, future directions, and hurdles to overcome.
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DOI：
10.1093/plphys/kiab478
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发表时间：
2022-02-04
期刊：
影响因子：
7.4
通讯作者：
Cuperus JT
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cuperus JT
单细胞基因组学通过揭示迄今未知的角色和基因调控过程，有可能彻底改变植物发育和组织对环境刺激的反应的研究。在这里，除了概述未来可能的实验方向外，我还将重点介绍单细胞基因组学在植物中的现状、新兴技术和应用。我描述了使更便宜和更大的实验和技术能够测量多种类型的分子，以更好地模拟和理解细胞类型及其在整个发育过程中的不同状态和轨迹的方法。最后，我讨论了单细胞研究的内在局限性，以及在农作物中广泛应用单细胞基因组学以产生最大可能的知识收益需要克服的技术障碍。随着单细胞基因组学有可能给植物发育的研究带来革命性的变化，我们将讨论当前的状态、未来的方向和需要克服的障碍。
Single-cell genomics has the potential to revolutionize the study of plant development and tissue-specific responses to environmental stimuli by revealing heretofore unknown players and gene regulatory processes. Here, I focus on the current state of single-cell genomics in plants, emerging technologies and applications, in addition to outlining possible future directions for experiments. I describe approaches to enable cheaper and larger experiments and technologies to measure multiple types of molecules to better model and understand cell types and their different states and trajectories throughout development. Lastly, I discuss the inherent limitations of single-cell studies and the technological hurdles that need to be overcome to widely apply single-cell genomics in crops to generate the greatest possible knowledge gain. With single-cell genomics having the potential to revolutionize the study of plant development, we address the current state, future directions, and hurdles to overcome.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
16.6
作者：
Dorrity MW;Alexandre CM;Hamm MO;Vigil AL;Fields S;Queitsch C;Cuperus JT
通讯作者：
Cuperus JT
DOI：
10.1126/science.aau0730
发表时间：
2018-09-28
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Cao J;Cusanovich DA;Ramani V;Aghamirzaie D;Pliner HA;Hill AJ;Daza RM;McFaline-Figueroa JL;Packer JS;Christiansen L;Steemers FJ;Adey AC;Trapnell C;Shendure J
通讯作者：
Shendure J
影响因子：
10.7
作者：
Alexandre, Cristina M.;Urton, James R.;Queitsch, Christin
通讯作者：
Queitsch, Christin
影响因子：
48
作者：
Gaudinier, Allison;Zhang, Lifang;Reece-Hoyes, John S.;Taylor-Teeples, Mallorie;Pu, Li;Liu, Zhijie;Breton, Ghislain;Pruneda-Paz, Jose L.;Kim, Dahae;Kay, Steve A.;Walhout, Albertha J. M.;Ware, Doreen;Brady, Siobhan M.
通讯作者：
Brady, Siobhan M.