The UCSC Genome Browser database: 2018 update.

The UCSC Genome Browser database: 2018 update.
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DOI:
10.1093/nar/gkx1020
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发表时间:
2018-01-04
影响因子:
14.9
通讯作者:
Kent WJ
Kent WJ
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Casper J;Zweig AS;Villarreal C;Tyner C;Speir ML;Rosenbloom KR;Raney BJ;Lee CM;Lee BT;Karolchik D;Hinrichs AS;Haeussler M;Guruvadoo L;Navarro Gonzalez J;Gibson D;Fiddes IT;Eisenhart C;Diekhans M;Clawson H;Barber GP;Armstrong J;Haussler D;Kuhn RM;Kent WJ

文献摘要

参考文献

被引文献

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UCSC 基因组浏览器 (https://genome.ucsc.edu) 提供了一个用于探索带注释的基因组组装的 Web 界面。程序集和注释轨道不断更新 - 去年添加了 12 个程序集和超过 28 个轨道。最近添加的两个内容是 CRISPR/Cas9 引导序列的显示和用于基因相互作用的交互式导航器。去年的其他升级包括变体注释集成器的命令行版本、对人类基因组变异协会变体命名法输入和输出的支持,以及修订后的突出显示工具,现在支持多个同时区域和颜色。
The UCSC Genome Browser (https://genome.ucsc.edu) provides a web interface for exploring annotated genome assemblies. The assemblies and annotation tracks are updated on an ongoing basis—12 assemblies and more than 28 tracks were added in the past year. Two recent additions are a display of CRISPR/Cas9 guide sequences and an interactive navigator for gene interactions. Other upgrades from the past year include a command-line version of the Variant Annotation Integrator, support for Human Genome Variation Society variant nomenclature input and output, and a revised highlighting tool that now supports multiple simultaneous regions and colors.
DOI: 10.1093/nar/gkj003
发表时间: 2006-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Güldener U;Münsterkötter M;Oesterheld M;Pagel P;Ruepp A;Mewes HW;Stümpflen V
通讯作者: Stümpflen V
DOI: 10.1038/nbt.3437
发表时间: 2016-02
影响因子: 46.9
作者:
Doench JG;Fusi N;Sullender M;Hegde M;Vaimberg EW;Donovan KF;Smith I;Tothova Z;Wilen C;Orchard R;Virgin HW;Listgarten J;Root DE
通讯作者: Root DE
DOI: 10.1093/bioinformatics/btu712
发表时间: 2015-03-01
期刊: Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子: --
作者:
Haeussler M;Raney BJ;Hinrichs AS;Clawson H;Zweig AS;Karolchik D;Casper J;Speir ML;Haussler D;Kent WJ
通讯作者: Kent WJ
DOI: 10.1093/nar/gkw1102
发表时间: 2017-01-04
影响因子: 14.9
作者:
Chatr-Aryamontri A;Oughtred R;Boucher L;Rust J;Chang C;Kolas NK;O'Donnell L;Oster S;Theesfeld C;Sellam A;Stark C;Breitkreutz BJ;Dolinski K;Tyers M
通讯作者: Tyers M
DOI: 10.1093/bioinformatics/btr020
发表时间: 2011-03-15
期刊: Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子: --
作者:
Down TA;Piipari M;Hubbard TJ
通讯作者: Hubbard TJ