Systematic evaluation of quantotypic peptides for targeted analysis of the human kinome.
Systematic evaluation of quantotypic peptides for targeted analysis of the human kinome.
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DOI：
10.1038/nmeth.3072
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发表时间：
2014-10
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Jorgensen, Claus
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Worboys, Jonathan D.;Sinclair, John;Yuan, Yinyin;Jorgensen, Claus
在靶向蛋白质组学中，至关重要的是肽不仅具有蛋白质型，而且能够准确地代表蛋白质的水平（定量）。许多方法用于鉴定蛋白型肽，但很少评估定量特性。在这里，我们表明，测量生物样品中蛋白型肽的比率可用于凭经验识别具有良好量子型特性的肽，并使用它来识别 21% 的人类激酶组的量子型肽。
In targeted proteomics it is critical that peptides are not only proteotypic, but also accurately represent the level of the protein (quantotypic). Numerous approaches are used to identify proteotypic peptides, but quantotypic properties are rarely assessed. Here, we show that measuring ratios of proteotypic peptides across biological samples can be used to empirically identify peptides with good quantotypic properties, and use this to identify quantotypic peptides for 21% of the human kinome.
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影响因子：
9.9
作者：
Lange, Vinzenz;Picotti, Paola;Domon, Bruno;Aebersold, Ruedi
通讯作者：
Aebersold, Ruedi
通过选择反应监测质谱法估计未标记样品的绝对蛋白质含量。
DOI：
10.1074/mcp.m111.013987
发表时间：
2012-03
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Ludwig C;Claassen M;Schmidt A;Aebersold R
通讯作者：
Aebersold R
影响因子：
14.9
作者：
Vizcaíno JA;Côté RG;Csordas A;Dianes JA;Fabregat A;Foster JM;Griss J;Alpi E;Birim M;Contell J;O'Kelly G;Schoenegger A;Ovelleiro D;Pérez-Riverol Y;Reisinger F;Ríos D;Wang R;Hermjakob H
通讯作者：
Hermjakob H
影响因子：
2.9
作者：
Patricelli, Matthew P.;Szardenings, A. Katrin;Kozarich, John W.
通讯作者：
Kozarich, John W.
影响因子：
4.4
作者：
Craig, R;Cortens, JP;Beavis, RC
通讯作者：
Beavis, RC