GRAMM-X public web server for protein-protein docking.
GRAMM-X public web server for protein-protein docking.
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DOI：
10.1093/nar/gkl206
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发表时间：
2006-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Vakser IA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tovchigrechko A;Vakser IA
蛋白质对接软件 GRAMM-X 及其网络界面 () 通过采用平滑电位、细化阶段和基于知识的评分，扩展了原始 GRAMM 快速傅里叶变换方法。 Web 服务器使用户免于依赖数据库的并行软件的复杂安装以及维护蛋白质对接模拟所需的大量硬件资源。提交给GRAMM-X服务器的对接问题由320处理器Linux集群处理。该服务器通过基准测试、几个月的公众使用以及参与 CAPRI 服务器跟踪进行了广泛的测试。
Protein docking software GRAMM-X and its web interface () extend the original GRAMM Fast Fourier Transformation methodology by employing smoothed potentials, refinement stage, and knowledge-based scoring. The web server frees users from complex installation of database-dependent parallel software and maintaining large hardware resources needed for protein docking simulations. Docking problems submitted to GRAMM-X server are processed by a 320 processor Linux cluster. The server was extensively tested by benchmarking, several months of public use, and participation in the CAPRI server track.
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影响因子：
14.9
作者：
Schneidman-Duhovny D;Inbar Y;Nussinov R;Wolfson HJ
通讯作者：
Wolfson HJ
影响因子：
2.9
作者：
Terashi, G;Takeda-Shitaka, M;Umeyama, H
通讯作者：
Umeyama, H
DOI：
10.1002/prot.10390
发表时间：
2003-07-01
期刊：
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND GENETICS
影响因子：
--
作者：
Chen, R;Mintseris, J;Weng, ZP
通讯作者：
Weng, ZP
影响因子：
8
作者：
Jiang, SL;Tovchigrechko, A;Vakser, IA
通讯作者：
Vakser, IA
影响因子：
8
作者：
Tovchigrechko, A;Vakser, IA
通讯作者：
Vakser, IA