Lamin A/C-promoter interactions specify chromatin state-dependent transcription outcomes.
Lamin A/C-promoter interactions specify chromatin state-dependent transcription outcomes.
复制标题
DOI：
10.1101/gr.159400.113
复制
发表时间：
2013-10
期刊：
影响因子：
7
通讯作者：
Collas P
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lund E;Oldenburg AR;Delbarre E;Freberg CT;Duband-Goulet I;Eskeland R;Buendia B;Collas P
核纤层与真核细胞核的组织有关。核纤层蛋白与基因组的关联通过大的染色质结构域发生，包括大部分但不完全是受抑制的基因。核纤层蛋白与调控元件的相互作用如何在不同的细胞环境中调节基因表达尚不清楚。我们在这里表明，在人类脂肪组织干细胞，核纤层蛋白A/C相互作用与不同的空间限制的亚启动子区域，内外周边和核内核纤层蛋白丰富的结构域。这些本地化的相互作用与不同的转录结果的方式依赖于局部染色质修饰。核纤层蛋白A/C的下调导致核纤层蛋白A/C从启动子上解离，并通过增强转录允许性来重塑抑制性和允许性组蛋白修饰，但不足以引发基因活化。成脂分化重置了大量的核纤层蛋白基因组协会全球和亚启动子水平，并重新定义相关的转录输出。我们建议，核纤层蛋白A/C作为一个调制器的本地基因表达的结果，通过相互作用与启动子上的可调位点，这些位置依赖性的转录读数可能会被重置分化。
The nuclear lamina is implicated in the organization of the eukaryotic nucleus. Association of nuclear lamins with the genome occurs through large chromatin domains including mostly, but not exclusively, repressed genes. How lamin interactions with regulatory elements modulate gene expression in different cellular contexts is unknown. We show here that in human adipose tissue stem cells, lamin A/C interacts with distinct spatially restricted subpromoter regions, both within and outside peripheral and intra-nuclear lamin-rich domains. These localized interactions are associated with distinct transcriptional outcomes in a manner dependent on local chromatin modifications. Down-regulation of lamin A/C leads to dissociation of lamin A/C from promoters and remodels repressive and permissive histone modifications by enhancing transcriptional permissiveness, but is not sufficient to elicit gene activation. Adipogenic differentiation resets a large number of lamin-genome associations globally and at subpromoter levels and redefines associated transcription outputs. We propose that lamin A/C acts as a modulator of local gene expression outcome through interaction with adjustable sites on promoters, and that these position-dependent transcriptional readouts may be reset upon differentiation.
登录
查看更多内容
影响因子：
3.7
作者：
Kolb, Thorsten;Maass, Kendra;Herrmann, Harald
通讯作者：
Herrmann, Harald
影响因子：
3.3
作者：
Boquest, AC;Shahdadfar, A;Brinchmann, JE
通讯作者：
Brinchmann, JE
影响因子：
64.8
作者：
Guelen, Lars;Pagie, Ludo;van Steensel, Bas
通讯作者：
van Steensel, Bas
影响因子：
7
作者：
McCord RP;Nazario-Toole A;Zhang H;Chines PS;Zhan Y;Erdos MR;Collins FS;Dekker J;Cao K
通讯作者：
Cao K
影响因子：
3.5
作者：
Baricheva, EA;Berrios, M;Fisher, PA
通讯作者：
Fisher, PA