Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for diffuse large B cell lymphoma.
Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for diffuse large B cell lymphoma.
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全基因组关联研究确定了弥漫性大B细胞淋巴瘤的多个易感基因座。
DOI：
10.1038/ng.3105
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发表时间：
2014-11
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Chanock SJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cerhan JR;Berndt SI;Vijai J;Ghesquières H;McKay J;Wang SS;Wang Z;Yeager M;Conde L;de Bakker PI;Nieters A;Cox D;Burdett L;Monnereau A;Flowers CR;De Roos AJ;Brooks-Wilson AR;Lan Q;Severi G;Melbye M;Gu J;Jackson RD;Kane E;Teras LR;Purdue MP;Vajdic CM;Spinelli JJ;Giles GG;Albanes D;Kelly RS;Zucca M;Bertrand KA;Zeleniuch-Jacquotte A;Lawrence C;Hutchinson A;Zhi D;Habermann TM;Link BK;Novak AJ;Dogan A;Asmann YW;Liebow M;Thompson CA;Ansell SM;Witzig TE;Weiner GJ;Veron AS;Zelenika D;Tilly H;Haioun C;Molina TJ;Hjalgrim H;Glimelius B;Adami HO;Bracci PM;Riby J;Smith MT;Holly EA;Cozen W;Hartge P;Morton LM;Severson RK;Tinker LF;North KE;Becker N;Benavente Y;Boffetta P;Brennan P;Foretova L;Maynadie M;Staines A;Lightfoot T;Crouch S;Smith A;Roman E;Diver WR;Offit K;Zelenetz A;Klein RJ;Villano DJ;Zheng T;Zhang Y;Holford TR;Kricker A;Turner J;Southey MC;Clavel J;Virtamo J;Weinstein S;Riboli E;Vineis P;Kaaks R;Trichopoulos D;Vermeulen RC;Boeing H;Tjonneland A;Angelucci E;Di Lollo S;Rais M;Birmann BM;Laden F;Giovannucci E;Kraft P;Huang J;Ma B;Ye Y;Chiu BC;Sampson J;Liang L;Park JH;Chung CC;Weisenburger DD;Chatterjee N;Fraumeni JF Jr;Slager SL;Wu X;de Sanjose S;Smedby KE;Salles G;Skibola CF;Rothman N;Chanock SJ
弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是最常见的淋巴瘤亚型，临床上具有侵袭性。为了确定DLBCL的遗传易感性位点，我们对3项新的全基因组关联研究（GWAS）和1项既往扫描进行了荟萃分析，共计3，857例欧洲血统病例和7，666例对照，并对1，359例病例和4，557例对照中的9个有希望的SNP进行了额外的基因分型。在我们的多阶段分析中，四个位点的五个独立SNP达到了全基因组显著性，标记为6p 25的rs 116446171。（EXOC 2;P= 2.33 × 10−21），rs 2523607在6p21.33（HLA-B;P= 2.40 × 10−10），2p23.3处rs79480871（NCOA 1;P= 4.23 × 10−8）和两个独立的SNP，rs 13255292和rs 4733601，在8q24.21（PVT 1;P= 9.98 × 10− 13和3.63 × 10−11）。这些数据为这种B细胞恶性肿瘤的遗传易感性提供了大量的新证据，并指出了DLBCL发病机制中涉及免疫识别和免疫功能的途径。
Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) is the most common lymphoma subtype and is clinically aggressive. To identify genetic susceptibility loci for DLBCL, we conducted a meta-analysis of 3 new genome-wide association studies (GWAS) and 1 previous scan, totaling 3,857 cases and 7,666 controls of European ancestry, with additional genotyping of 9 promising SNPs in 1,359 cases and 4,557 controls. In our multi-stage analysis, five independent SNPs in four loci achieved genome-wide significance marked by rs116446171 at 6p25.3 (EXOC2;P= 2.33 × 10−21), rs2523607 at 6p21.33 (HLA-B;P= 2.40 × 10−10), rs79480871 at 2p23.3 (NCOA1;P= 4.23 × 10−8) and two independent SNPs, rs13255292 and rs4733601, at 8q24.21 (PVT1;P= 9.98 × 10−13and 3.63 × 10−11, respectively). These data provide substantial new evidence for genetic susceptibility to this B cell malignancy and point to pathways involved in immune recognition and immune function in the pathogenesis of DLBCL.
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影响因子：
30.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
3.7
作者：
Kashatus, David F.
通讯作者：
Kashatus, David F.
DOI：
10.1093/bioinformatics/btt356
发表时间：
2013-09-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Barenboim M;Manke T
通讯作者：
Manke T
影响因子：
254.7
作者：
Flowers, Christopher R.;Sinha, Rajni;Vose, Julie M.
通讯作者：
Vose, Julie M.