Blind protein structure prediction using accelerated free-energy simulations.
Blind protein structure prediction using accelerated free-energy simulations.
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DOI：
10.1126/sciadv.1601274
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发表时间：
2016-11
期刊：
影响因子：
13.6
通讯作者：
Dill KA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Perez A;Morrone JA;Brini E;MacCallum JL;Dill KA
蛋白质结构可以通过结合原子模拟和粗略信息来预测。我们报告了一种新加速方法[采用有限数据建模（MELD）]的关键原理证明，用于通过分子动力学模拟预测蛋白质结构。它表明，这种满足玻尔兹曼要求的技术现在足够快速和准确，可以在结构预测批判性评估 (CASP) 全社区盲竞赛中的有限测试中预测天然蛋白质结构。
Protein structures can be predicted by combining atomistic simulations and coarse information. We report a key proof of principle of a new acceleration method [Modeling Employing Limited Data (MELD)] for predicting protein structures by molecular dynamics simulation. It shows that such Boltzmann-satisfying techniques are now sufficiently fast and accurate to predict native protein structures in a limited test within the Critical Assessment of Structure Prediction (CASP) community-wide blind competition.
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影响因子：
15
作者：
Naganathan, AN;Muñoz, V
通讯作者：
Muñoz, V
基于网格的主链校正对隐式溶剂模拟的FF12SB蛋白力场。
影响因子：
5.5
作者：
Perez A;MacCallum JL;Brini E;Simmerling C;Dill KA
通讯作者：
Dill KA
通过分子动力学系综的结构选择和平均来细化蛋白质结构。
影响因子：
5.5
作者：
Mirjalili, Vahid;Feig, Michael
通讯作者：
Feig, Michael
影响因子：
5.6
作者：
Korycinski, Mateusz;Albrecht, Reinhard;Lupas, Andrei N.
通讯作者：
Lupas, Andrei N.
DOI：
10.1073/pnas.1506788112
发表时间：
2015-06-02
影响因子：
11.1
作者：
MacCallum, Justin L.;Perez, Alberto;Dill, Ken A.
通讯作者：
Dill, Ken A.