GeConT 2: gene context analysis for orthologous proteins, conserved domains and metabolic pathways.
GeConT 2: gene context analysis for orthologous proteins, conserved domains and metabolic pathways.
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DOI：
10.1093/nar/gkn330
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发表时间：
2008-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Merino E
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Martinez-Guerrero CE;Ciria R;Abreu-Goodger C;Moreno-Hagelsieb G;Merino E
基因上下文工具 (GeConT) 允许用户可视化一个基因或一组基因的基因组上下文以及它们在完全测序的细菌基因组中的直系同源关系。新版本的服务器整合了来自 COG、Pfam 和 KEGG 数据库的信息，使用户能够以集成的图形方式表示多个级别的基因功能、其系统发育分布及其基因组背景。任何基因的序列以及 5' 或 3' 调控区都可以轻松检索，极大地方便了进一步类型的分析。 GeConT 2 可从以下网址获取：http://bioinfo.ibt.unam.mx/gecont。
The Gene Context Tool (GeConT) allows users to visualize the genomic context of a gene or a group of genes and their orthologous relationships within fully sequenced bacterial genomes. The new version of the server incorporates information from the COG, Pfam and KEGG databases, allowing users to have an integrated graphical representation of the function of genes at multiple levels, their phylogenetic distribution and their genomic context. The sequence of any of the genes can be easily retrieved, as well as the 5′ or 3′ regulatory regions, greatly facilitating further types of analysis. GeConT 2 is available at: http://bioinfo.ibt.unam.mx/gecont.
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