Functional annotation of native enhancers with a Cas9-histone demethylase fusion.
Functional annotation of native enhancers with a Cas9-histone demethylase fusion.
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DOI：
10.1038/nmeth.3325
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发表时间：
2015-05
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Maehr, Rene
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kearns, Nicola A.;Pham, Hannah;Tabak, Barbara;Genga, Ryan M.;Silverstein, Noah J.;Garber, Manuel;Maehr, Rene
对哺乳动物增强子功能的理解受到缺乏快速和彻底测试其细胞类型特异性功能的技术的限制。在这里，我们使用核酸酶缺陷型（d）Cas9组蛋白脱甲基酶融合体来功能性地表征先前描述的和新的增强子元件在胚胎干细胞状态中的作用。此外，我们将dCas 9-LSD 1在增强子处的作用机制与先前的dCas 9效应子区分开。
Understanding of mammalian enhancer function is limited by the lack of a technology to rapidly and thoroughly test their cell type-specific function. Here, we use a nuclease-deficient (d)Cas9 histone demethylase fusion to functionally characterize previously described and novel enhancer elements for their roles in the embryonic stem cell state. Further, we distinguish the mechanism of action of dCas9-LSD1 at enhancers from previous dCas9-effectors.
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影响因子：
64.8
作者：
Ernst, Jason;Kheradpour, Pouya;Mikkelsen, Tarjei S.;Shoresh, Noam;Ward, Lucas D.;Epstein, Charles B.;Zhang, Xiaolan;Wang, Li;Issner, Robbyn;Coyne, Michael;Ku, Manching;Durham, Timothy;Kellis, Manolis;Bernstein, Bradley E.
通讯作者：
Bernstein, Bradley E.
影响因子：
64.8
作者：
Konermann S;Brigham MD;Trevino AE;Joung J;Abudayyeh OO;Barcena C;Hsu PD;Habib N;Gootenberg JS;Nishimasu H;Nureki O;Zhang F
通讯作者：
Zhang F
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.5
作者：
Hnisz D;Abraham BJ;Lee TI;Lau A;Saint-André V;Sigova AA;Hoke HA;Young RA
通讯作者：
Young RA
DOI：
10.1126/science.1232033
发表时间：
2013-02-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Mali P;Yang L;Esvelt KM;Aach J;Guell M;DiCarlo JE;Norville JE;Church GM
通讯作者：
Church GM